RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 GHRHP01286 108 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YGX0 51 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFC1O43677 76 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
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RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2BP63146 152 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 KLKP1Q107X0 134 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00846Q9NV44 126 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WVE0 104 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 H7BZZ5 65 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf197Q8N268 126 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 BRK1Q8WUW1 75 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00167Q96N53 147 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R378 163 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8NDZ9 215 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf137Q5JT78 98 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2D-28P01615 120 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.52□□□□□ -1.36
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 CCKP06307 115 aa6.52□□□□□ -1.37
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RABGEF1-205ENST00000450873 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV7-43P04211 117 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 PMAIP1Q13794 54 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0U1RQV1 116 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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RABGEF1-205ENST00000450873 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 UBL5Q9BZL1 73 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 REG3GQ6UW15 175 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR15Q8IV56 129 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 PRYO14603 147 aa6.47□□□□□ -1.37
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RABGEF1-205ENST00000450873 F8WEM9 126 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF861PO60384 105 aa6.46□□□□□ -1.37
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV6-57P01721 117 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 CD164Q04900 197 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 DIRC1Q969H9 104 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2AP49459 152 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-205ENST00000450873 H0Y9J4 135 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 ERC2-IT1O76042 136 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-205ENST00000450873 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-205ENST00000450873 H3BQ85 93 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRX8 168 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 PDE6GP18545 87 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.35□□□□□ -1.39
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 COX7BP24311 80 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-205ENST00000450873 Q1T7F1 81 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00575Q6W349 94 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 Q9BRP9 147 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZVQ6 151 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-8P60410 259 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 NREPQ16612 68 aa6.32□□□□□ -1.4
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