RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058	B9D2	Q9BPU9	175 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0G2JQZ4	141 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0U1RQV1	116 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058		H0Y9J4	135 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058		K7EQZ3	153 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	SPRR1B	P22528	89 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	LCE6A	A0A183	80 aa		10.53	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2A	P49459	152 aa		10.53	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf195	Q5TG92	126 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058		A0A087WSZ3	146 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	HCG22	E2RYF7	251 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	PANO1	I0J062	215 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TOM1-210	ENST00000449058	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TOM1-210	ENST00000449058	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TOM1-210	ENST00000449058	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TOM1-210	ENST00000449058	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	BRK1	Q8WUW1	75 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058		A0A087WTM6	91 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058	PRR15	Q8IV56	129 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TOM1-210	ENST00000449058		A8MWP4	228 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00483	Q53H64	154 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058	CASC2	Q6XLA1	102 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZR54	194 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1-210	ENST00000449058	RTL8C	O15255	209 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	MP68	P56378	58 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	hDV103S1	A0JD37	113 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058		Q96NJ1	140 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFB1	O75438	58 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	PMAIP1	Q13794	54 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00208	Q96KT6	92 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058		H3BPC8	53 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058		H0Y9P7	68 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF861P	O60384	105 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	MOBP	Q13875	183 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	DNAH2	Q9P225	4427 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOM1-210	ENST00000449058	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	PRR4	Q16378	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	CD164	Q04900	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GVX0	72 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV7-43	P04211	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058		Q1T7F1	81 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	TG	P01266	2768 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.02	□□□□□ -0.8
TOM1-210	ENST00000449058	CDK2AP2	O75956	126 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TOM1-210	ENST00000449058	LY6G6C	O95867	125 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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