RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.96□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 CD164Q04900 197 aa5.95□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.95□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 LIMD2Q9BT23 127 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 K7ERJ3 54 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 XP32Q5T750 250 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 Q5XG85 94 aa5.91□□□□□ -1.46
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ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.91□□□□□ -1.46
ATG4B-210ENST00000428861 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.91□□□□□ -1.46
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ATG4B-210ENST00000428861 C1orf195Q5TG92 126 aa5.9□□□□□ -1.46
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ATG4B-210ENST00000428861 A6NJY4 79 aa5.89□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 F8WEM9 126 aa5.89□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 H3BUT2 72 aa5.89□□□□□ -1.47
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ATG4B-210ENST00000428861 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.89□□□□□ -1.47
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ATG4B-210ENST00000428861 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.89□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf92A6NGG3 77 aa5.88□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 H0YGX0 51 aa5.88□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.87□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 CLEC2BQ92478 149 aa5.87□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 Q6JHZ5 121 aa5.86□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.86□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GX51 115 aa5.83□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 TCL1BO95988 128 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 SNCGO76070 127 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 FABP2P12104 132 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB2P49721 201 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0U1RQV1 116 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 H3BMG7 143 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 PCOTHQ58A44 107 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 Q6Q795 121 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PNM2 257 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GV72 72 aa5.77□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.77□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 COX6CP09669 75 aa5.76□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM6P0DI80 62 aa5.76□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 TEN1Q86WV5 123 aa5.76□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WSZ3 146 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 LST1O00453 97 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 DNAL4O96015 105 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 Q96NJ1 140 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.74□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 GHRHP01286 108 aa5.73□□□□□ -1.49
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ATG4B-210ENST00000428861 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.72□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 LCE2CQ5TA81 110 aa5.72□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.72□□□□□ -1.49
ATG4B-210ENST00000428861 M0R143 59 aa5.71□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2V1Q13404 147 aa5.71□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.71□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.71□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 H3BQ85 93 aa5.7□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.68□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 CCKP06307 115 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 TSTD3H0UI37 97 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 Q75L30 129 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 DSCR10P59022 87 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 BATFQ16520 125 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-210ENST00000428861 ATXN8Q156A1 80 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV4-1P06312 121 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 SIGMAR1Q99720 223 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 VPS25Q9BRG1 176 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 A8MUU9 505 aa5.62□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 MT1HP80294 61 aa5.62□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 DSCR8Q96T75 97 aa5.62□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.61□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 TAX1BP3O14907 124 aa5.61□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.6□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 C9JAW5 83 aa5.59□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZQT0 140 aa5.59□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.59□□□□□ -1.51
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf118A6NHY6 69 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00313P59037 77 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4B-210ENST00000428861 MTURNQ8N3F0 131 aa5.56□□□□□ -1.52
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