RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf86A6NJI1 115 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 SPRR1AP35321 89 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0B4J2C4 111 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 MT-ATP8P03928 68 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 HERVK_113P61574 105 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 TIMM17AQ99595 171 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 ERC2-IT1O76042 136 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV6-57P01721 117 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF815PA8K554 130 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 TCL1BO95988 128 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 SPANXCQ9NY87 97 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 PRYO14603 147 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 PSMB2P49721 201 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 COX17Q14061 63 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 PMVKQ15126 192 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 IMUPQ9GZP8 106 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 H3BT86 120 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 LEPROTO15243 131 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 MT2AP02795 61 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ATXN8Q156A1 80 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 NEBP20929 6669 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 SNCGO76070 127 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 IFITM1P13164 125 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-209ENST00000428450 B5MCH6 92 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 J3QQQ9 107 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 ACYP1P07311 99 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 Q9BRP9 147 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0J9YXY3 114 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM223A0PJW6 202 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LIMD2Q9BT23 127 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 TIMM17BO60830 172 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 MT1FP04733 61 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 A4D1N5 150 aa5.93□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 C9JAW5 83 aa5.93□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.93□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 NCR3O14931 201 aa5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 COX6CP09669 75 aa5.91□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00158P58513 81 aa5.91□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.91□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.9□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LST1O00453 97 aa5.9□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LITAFQ99732 161 aa5.9□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00846Q9NV44 126 aa5.9□□□□□ -1.46
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0U1RRA0 63 aa5.89□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 Q6ZRX8 168 aa5.89□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.89□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1B0GX51 115 aa5.88□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC179H3BU77 68 aa5.88□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.88□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 TRIAP1O43715 76 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 C1orf195Q5TG92 126 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 SFTA2Q6UW10 78 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00643Q86TS7 51 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 COPS9Q8WXC6 57 aa5.87□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.86□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 HERV-K104P63124 156 aa5.86□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 UQCRQO14949 82 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 TRACP01848 142 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP10-10P60014 251 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.85□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 Q5XG85 94 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.84□□□□□ -1.47
DDX39B-209ENST00000428450 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 H7C2G1 150 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 SPRR1BP22528 89 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 CD164Q04900 197 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 Q1RN00 199 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM29Q86T20 159 aa5.8□□□□□ -1.48
DDX39B-209ENST00000428450 COX7CP15954 63 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.8 ms