RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRU-204ENST00000428026 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 H3BS24 57 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-204ENST00000428026 Q5XG85 94 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRU-204ENST00000428026 ATMQ13315 3056 aa9.12□□□□□ -0.95
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PTPRU-204ENST00000428026 COL12A1Q99715 3063 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRU-204ENST00000428026 Q8NDZ9 215 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRU-204ENST00000428026 OXTP01178 125 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRU-204ENST00000428026 Q5VV11 94 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRU-204ENST00000428026 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRU-204ENST00000428026 ZZEF1O43149 2961 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-204ENST00000428026 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR1AP35321 89 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-204ENST00000428026 Q5W150 140 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRU-204ENST00000428026 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-204ENST00000428026 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-204ENST00000428026 KALRNO60229 2985 aa8.83□□□□□ -1
PTPRU-204ENST00000428026 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRU-204ENST00000428026 LRBAP50851 2863 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-204ENST00000428026 SPEGQ15772 3267 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-204ENST00000428026 USP34Q70CQ2 3546 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-204ENST00000428026 S4R3F8 94 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 APCP25054 2843 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 M0R2T5 61 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 LCE6AA0A183 80 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 SPRR1BP22528 89 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRU-204ENST00000428026 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRU-204ENST00000428026 TENM4Q6N022 2769 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRU-204ENST00000428026 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRU-204ENST00000428026 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRU-204ENST00000428026 R4GN34 69 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRU-204ENST00000428026 ROMO1P60602 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-2P60368 255 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRTAP10-1P60331 282 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZANQ9Y493 2812 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-204ENST00000428026 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.6□□□□□ -1.03
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