RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.06□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 DMAC1Q96GE9 116 aa9.06□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.06□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 ROMO1P60602 79 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 CHTF8P0CG12 524 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 LAMA5O15230 3695 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 ZNF575Q86XF7 245 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-11P60412 298 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.02□□□□□ -0.96
CTIF-202ENST00000382998 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 NDUFAF8A1L188 74 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 X6R8D5 127 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 CR1P17927 2039 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 PRLHP81277 87 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 C7orf33Q8WU49 177 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.98□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 CRIPTQ9P021 101 aa8.97□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 APCP25054 2843 aa8.97□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.96□□□□□ -0.97
CTIF-202ENST00000382998 RELNP78509 3460 aa8.96□□□□□ -0.98
CTIF-202ENST00000382998 TENM4Q6N022 2769 aa8.95□□□□□ -0.98
CTIF-202ENST00000382998 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-202ENST00000382998 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-202ENST00000382998 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.9□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 ZANQ9Y493 2812 aa8.9□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PNM2 257 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.89□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 IGLV6-57P01721 117 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZR54 194 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GUV1 79 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-202ENST00000382998 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 DSCR10P59022 87 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.81□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.81□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 HRES1P13985 223 aa8.8□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.8□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 J3QL48 77 aa8.79□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2-30P06310 120 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-202ENST00000382998 H3BNG1 76 aa8.77□□□□□ -1.01
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CTIF-202ENST00000382998 Q8N377 158 aa8.75□□□□□ -1.01
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CTIF-202ENST00000382998 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.74□□□□□ -1.01
CTIF-202ENST00000382998 A0A087X002 238 aa8.72□□□□□ -1.01
CTIF-202ENST00000382998 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.72□□□□□ -1.01
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZRX8 168 aa8.71□□□□□ -1.01
CTIF-202ENST00000382998 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.71□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 FAM229AH3BQW9 127 aa8.68□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 FAM104AQ969W3 186 aa8.68□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 NF1P21359 2839 aa8.68□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.67□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.67□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 RTL8CO15255 209 aa8.66□□□□□ -1.02
CTIF-202ENST00000382998 A0A0G2JQZ4 141 aa8.64□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PNN7 141 aa8.64□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 IGFL1Q6UW32 110 aa8.64□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 FBN2P35556 2912 aa8.63□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 LINC00483Q53H64 154 aa8.62□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.62□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 LCE6AA0A183 80 aa8.61□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.6□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 APLNQ9ULZ1 77 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-202ENST00000382998 CASC10Q5T4H9 136 aa8.58□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 A8MUU9 505 aa8.57□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 SPRR4Q96PI1 79 aa8.57□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.56□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 IGLV7-43P04211 117 aa8.54□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GU33 70 aa8.53□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.53□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.52□□□□□ -1.04
CTIF-202ENST00000382998 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WTM6 91 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.51□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 PRR34Q9NV39 138 aa8.49□□□□□ -1.05
CTIF-202ENST00000382998 ZNF861PO60384 105 aa8.48□□□□□ -1.05
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