RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 A8MUN3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 ITPR2Q14571 2701 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-202ENST00000366197 FRYQ5TBA9 3013 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 TACC2O95359 2948 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 COL12A1Q99715 3063 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 VCANP13611 3396 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 ATMQ13315 3056 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.49□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 ITPR1Q14643 2758 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 CD164Q04900 197 aa6.48□□□□□ -1.37
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ZNF548-202ENST00000366197 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.47□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 HIVEP1P15822 2718 aa6.47□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 FAM104AQ969W3 186 aa6.47□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.46□□□□□ -1.37
ZNF548-202ENST00000366197 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.46□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 TENM4Q6N022 2769 aa6.45□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 Q8N1X5 172 aa6.45□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.44□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.43□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZSA8 131 aa6.43□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.43□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.42□□□□□ -1.38
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ZNF548-202ENST00000366197 LINC01554Q52M75 96 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR1AP35321 89 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-202ENST00000366197 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.38□□□□□ -1.39
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ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF548-202ENST00000366197 Q8NDZ9 215 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0D9SG42 100 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF548-202ENST00000366197 LCE6AA0A183 80 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 KALRNO60229 2985 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 ZZEF1O43149 2961 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 SPEGQ15772 3267 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 EYSQ5T1H1 3165 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR1BP22528 89 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 HRES1P13985 223 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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ZNF548-202ENST00000366197 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-202ENST00000366197 M0R2T5 61 aa6.29□□□□□ -1.4
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ZNF548-202ENST00000366197 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.26□□□□□ -1.41
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ZNF548-202ENST00000366197 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.25□□□□□ -1.41
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ZNF548-202ENST00000366197 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1B0GU33 70 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-2P60368 255 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 Q5VSD8 79 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 SPINK7P58062 85 aa6.21□□□□□ -1.41
ZNF548-202ENST00000366197 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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ZNF548-202ENST00000366197 Q5W150 140 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-202ENST00000366197 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZR54 194 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-202ENST00000366197 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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ZNF548-202ENST00000366197 LRBAP50851 2863 aa6.16□□□□□ -1.42
ZNF548-202ENST00000366197 PANO1I0J062 215 aa6.15□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 S4R3F8 94 aa6.15□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.14□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.13□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.13□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00483Q53H64 154 aa6.13□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.13□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 ZANQ9Y493 2812 aa6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 DMAC1Q96GE9 116 aa6.11□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 R4GN34 69 aa6.11□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 Q75L30 129 aa6.1□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 LUZP6Q538Z0 58 aa6.09□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 USP34Q70CQ2 3546 aa6.09□□□□□ -1.43
ZNF548-202ENST00000366197 A0A087X002 238 aa6.06□□□□□ -1.44
ZNF548-202ENST00000366197 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.06□□□□□ -1.44
ZNF548-202ENST00000366197 TENM3Q9P273 2699 aa6.06□□□□□ -1.44
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