RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 COX7CP15954 63 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM29Q86T20 159 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa16.58■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZVQ6 151 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf137Q5JT78 98 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP10-2P60368 255 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD8-201ENST00000313173 F8WEM9 126 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM20Q8N5G0 67 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD8-201ENST00000313173 SPRR1BP22528 89 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 CRYGAP11844 174 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PNM2 257 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 FAT2Q9NYQ8 4349 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GW54 56 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 Q8NBF4 154 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 DNAH11Q96DT5 4516 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXD8-201ENST00000313173 HAMPP81172 84 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 SERP2Q8N6R1 65 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 SPRR4Q96PI1 79 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 CXCL6P80162 114 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 DNAH8Q96JB1 4490 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXD8-201ENST00000313173 IGFL1Q6UW32 110 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 FAM30AQ9NZY2 134 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WVE0 104 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 NREPQ16612 68 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 RYR2Q92736 4967 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 PKD1P98161 4303 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZSA8 131 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP10-1P60331 282 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF861PO60384 105 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0G2JQZ4 141 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00483Q53H64 154 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 SCXQ7RTU7 201 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM258P61165 79 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00336Q6ZUF6 198 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD8-201ENST00000313173 J3KT08 172 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV7-43P04211 117 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD8-201ENST00000313173 RPS28P62857 69 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD8-201ENST00000313173 BPY2O14599 106 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD8-201ENST00000313173 CYSTM1Q9H1C7 97 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WSZ3 146 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD8-201ENST00000313173 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV4-1P06312 121 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GVY2 172 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N9L7 120 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 PKHD1P08F94 4074 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 RYR3Q15413 4870 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV7A0A075B6U4 112 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD8-201ENST00000313173 ANAPC11Q9NYG5 84 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD8-201ENST00000313173 MOBPQ13875 183 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD8-201ENST00000313173 DSCR10P59022 87 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-201ENST00000313173 LRP1BQ9NZR2 4599 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf197Q8N268 126 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD8-201ENST00000313173 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-201ENST00000313173 K7EQZ3 153 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB116Q30KQ4 102 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00472Q9H8W2 130 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-201ENST00000313173 KLKP1Q107X0 134 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD8-201ENST00000313173 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD8-201ENST00000313173 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM236CP0DP71 79 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD8-201ENST00000313173 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-201ENST00000313173 H7BZZ5 65 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM229BQ4G0N7 80 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-201ENST00000313173 OXTP01178 125 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 Q96NJ1 140 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 A8MWP4 228 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFC1O43677 76 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 HCG22E2RYF7 251 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 CD164Q04900 197 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf47Q569G3 176 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087X002 238 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 PRR15Q8IV56 129 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 SERP1Q9Y6X1 66 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXD8-201ENST00000313173 APOBP04114 4563 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXD8-201ENST00000313173 OCR1Q9BZK8 76 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXD8-201ENST00000313173 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD8-201ENST00000313173 SNURFQ9Y675 71 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFB1O75438 58 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 WFDC13Q8IUB5 93 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 Q5XG85 94 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD8-201ENST00000313173 CASC2Q6XLA1 102 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD8-201ENST00000313173 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD8-201ENST00000313173 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms