RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RYR2Q92736 4967 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PKHD1P08F94 4074 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2BP63146 152 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ERC2-IT1O76042 136 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PRLHP81277 87 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP10-1P60331 282 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GYY9 64 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N377 158 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 HAMPP81172 84 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZSA8 131 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 PRO0628Q9UI54 55 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 SCXQ7RTU7 201 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6JHZ5 121 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 H0Y9J4 135 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BQ85 93 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 BCE1O60756 84 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 F8WEM9 126 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf195Q5TG92 126 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GVY2 172 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2AP49459 152 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 RYR3Q15413 4870 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZQT0 140 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM29Q86T20 159 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 CCKP06307 115 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
RABGEF1-201ENST00000284957 UBL5Q9BZL1 73 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf137Q5JT78 98 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 H7BZZ5 65 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR1BP22528 89 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF861PO60384 105 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV7-43P04211 117 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE6GP18545 87 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N9L7 120 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR4Q96PI1 79 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JQZ4 141 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PNM2 257 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00483Q53H64 154 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BS24 57 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR4Q16378 134 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFL1Q6UW32 110 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 FAT1Q14517 4588 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PSPHP1O15172 72 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZVQ6 151 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8NBF4 154 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NREPQ16612 68 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 KLKP1Q107X0 134 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GW54 56 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 BPY2O14599 106 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 MOBPQ13875 183 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 PMAIP1Q13794 54 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPG2P98160 4391 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087X002 238 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WSZ3 146 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MU10 97 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 CXCL6P80162 114 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.3 ms