RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 LCA10Q71F78 164 aa7.21□□□□□ -1.25
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UBASH3B-201ENST00000284273 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.8□□□□□ -1.32
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UBASH3B-201ENST00000284273 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.79□□□□□ -1.32
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UBASH3B-201ENST00000284273 USP34Q70CQ2 3546 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 Q5XG85 94 aa6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 LRBAP50851 2863 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 ITPR2Q14571 2701 aa6.65□□□□□ -1.34
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 TRANK1O15050 2925 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF292O60281 2723 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 NOTCH1P46531 2555 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 ATMQ13315 3056 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.59□□□□□ -1.35
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