RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 IGFL1Q6UW32 110 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 SMIM29Q86T20 159 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 SERP2Q8N6R1 65 aa7.58□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 H3BQ85 93 aa7.57□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH2Q9P225 4427 aa7.56□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.56□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.56□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 Q8NBF4 154 aa7.55□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.54□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 K7EQZ3 153 aa7.53□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.53□□□□□ -1.2
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP10-2P60368 255 aa7.52□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 CXCL6P80162 114 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.51□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 IGKV4-1P06312 121 aa7.5□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.5□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.5□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 BCE1O60756 84 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.49□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 Q6ZR54 194 aa7.48□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 H0Y9J4 135 aa7.47□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 MOBPQ13875 183 aa7.46□□□□□ -1.21
SEH1L-201ENST00000262124 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.46□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 DSCR10P59022 87 aa7.45□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 CRYGAP11844 174 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.44□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 PRR4Q16378 134 aa7.43□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 SPRR4Q96PI1 79 aa7.42□□□□□ -1.22
SEH1L-201ENST00000262124 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.38□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP10-1P60331 282 aa7.37□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.37□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF861PO60384 105 aa7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 HCG22E2RYF7 251 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 NDUFS5O43920 106 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.34□□□□□ -1.23
SEH1L-201ENST00000262124 PKHD1P08F94 4074 aa7.34□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 H7BZZ5 65 aa7.33□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 OCR1Q9BZK8 76 aa7.33□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.33□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV7-43P04211 117 aa7.32□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 FAM236CP0DP71 79 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 CASC2Q6XLA1 102 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 TMEM258P61165 79 aa7.31□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 OXTP01178 125 aa7.29□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 SPRR1BP22528 89 aa7.29□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.29□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00208Q96KT6 92 aa7.29□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 CDK2AP2O75956 126 aa7.28□□□□□ -1.24
SEH1L-201ENST00000262124 NDUFB1O75438 58 aa7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 A0A087X002 238 aa7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 J3KT08 172 aa7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 PRR15Q8IV56 129 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 KLKP1Q107X0 134 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.26□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 A8MWP4 228 aa7.25□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GW54 56 aa7.24□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.24□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 hDV103S1A0JD37 113 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 PCOTHQ58A44 107 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-201ENST00000262124 A0A0U1RQV1 116 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 FAT1Q14517 4588 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 H0Y9P7 68 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 MP68P56378 58 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00483Q53H64 154 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 C4orf26Q17RF5 130 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 Q96NJ1 140 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 PKD1P98161 4303 aa7.16□□□□□ -1.26
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.15□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.15□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.14□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.14□□□□□ -1.27
SEH1L-201ENST00000262124 C5orf47Q569G3 176 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms