RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 LAMA1P25391 3075 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 K7EQZ3 153 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP10-9P60411 292 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 APLNQ9ULZ1 77 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 ATMQ13315 3056 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 Q8NAQ8 132 aa2.31□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 A8MU10 97 aa2.3□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.3□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 FRYLO94915 3013 aa2.3□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 SMR3AQ99954 134 aa2.3□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 IGFL1Q6UW32 110 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 PRR34Q9NV39 138 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 Q1T7F1 81 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 USP24Q9UPU5 2620 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 AKAP13Q12802 2813 aa2.29□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.28□□□□□ -2.04
LATS1-201ENST00000253339 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 CEP295Q9C0D2 2601 aa2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 CR1P17927 2039 aa2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 KALRNO60229 2985 aa2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.26□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.26□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 SPRR4Q96PI1 79 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 R4GN34 69 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 DMAC1Q96GE9 116 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 Q5W150 140 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 Q6ZR54 194 aa2.25□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 EPG5Q9HCE0 2579 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 STAB1Q9NY15 2570 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A087WTM6 91 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 MAST4O15021 2626 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 LRBAP50851 2863 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A1B0GU33 70 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A1W2PNM2 257 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 PANO1I0J062 215 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 Q5VV11 94 aa2.24□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.23□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.23□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 TACC2O95359 2948 aa2.23□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 CENPEQ02224 2701 aa2.23□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 ITPR1Q14643 2758 aa2.23□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A0G2JQZ4 141 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A1W2PNN7 141 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 HRES1P13985 223 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 Q6ZSA8 131 aa2.22□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.21□□□□□ -2.05
LATS1-201ENST00000253339 A0A0D9SG42 100 aa2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 CSAG1Q6PB30 78 aa2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 ATRQ13535 2644 aa2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.21□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 SPINK7P58062 85 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 ROMO1P60602 79 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 CHD6Q8TD26 2715 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 EYSQ5T1H1 3165 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 C9orf92A6NGG3 77 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 K7EIL1 84 aa2.2□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 HECTD1Q9ULT8 2610 aa2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 Q8NDZ9 215 aa2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 CUBNO60494 3623 aa2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 A0A096LNT2 108 aa2.18□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 COL12A1Q99715 3063 aa2.18□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 NOTCH1P46531 2555 aa2.18□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 ZNF292O60281 2723 aa2.17□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 SPRR1BP22528 89 aa2.17□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 UNC79Q9P2D8 2635 aa2.17□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 A6NN06 94 aa2.17□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.16□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.16□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.16□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 SPRR1AP35321 89 aa2.15□□□□□ -2.06
LATS1-201ENST00000253339 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.15□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms