RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 Q5W150 140 aa7.33□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.3□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP10-3P60369 221 aa7.3□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 M0QZ58 72 aa7.28□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 Q5XG85 94 aa7.28□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.28□□□□□ -1.24
GREB1-201ENST00000234142 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.26□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.26□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 A0A096LNT2 108 aa7.26□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.24□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 CHD6Q8TD26 2715 aa7.23□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 SPRR1AP35321 89 aa7.22□□□□□ -1.25
GREB1-201ENST00000234142 SPRR1BP22528 89 aa7.2□□□□□ -1.26
GREB1-201ENST00000234142 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.19□□□□□ -1.26
GREB1-201ENST00000234142 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.18□□□□□ -1.26
GREB1-201ENST00000234142 NOTCH1P46531 2555 aa7.16□□□□□ -1.26
GREB1-201ENST00000234142 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.16□□□□□ -1.26
GREB1-201ENST00000234142 COL6A5A8TX70 2615 aa7.13□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 OXTP01178 125 aa7.12□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 Q6ZR54 194 aa7.11□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 Q5VSD8 79 aa7.1□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 PANO1I0J062 215 aa7.09□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 EP400Q96L91 3159 aa7.09□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.09□□□□□ -1.27
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.07□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 Q8NDZ9 215 aa7.06□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 CEP350Q5VT06 3117 aa7.05□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.04□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.04□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.04□□□□□ -1.28
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7□□□□□ -1.29
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP1-1Q07627 177 aa7□□□□□ -1.29
GREB1-201ENST00000234142 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GREB1-201ENST00000234142 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GREB1-201ENST00000234142 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.95□□□□□ -1.3
GREB1-201ENST00000234142 A8MUU9 505 aa6.94□□□□□ -1.3
GREB1-201ENST00000234142 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GREB1-201ENST00000234142 LCE6AA0A183 80 aa6.9□□□□□ -1.3
GREB1-201ENST00000234142 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 TNP1P09430 55 aa6.89□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP10-1P60331 282 aa6.89□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 ITPR2Q14571 2701 aa6.88□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 NDUFAF8A1L188 74 aa6.88□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 C5orf42Q9H799 3197 aa6.88□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 PCNTO95613 3336 aa6.87□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 A6NN06 94 aa6.84□□□□□ -1.31
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.83□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 APCP25054 2843 aa6.82□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP10-2P60368 255 aa6.81□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.81□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 CFAP54Q96N23 3096 aa6.8□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 UTRNP46939 3433 aa6.8□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 A0A087X002 238 aa6.8□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.8□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 PP632Q6XCG6 107 aa6.79□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 ZNF292O60281 2723 aa6.78□□□□□ -1.32
GREB1-201ENST00000234142 A8MU10 97 aa6.76□□□□□ -1.33
GREB1-201ENST00000234142 A0A0C4DFX4 3053 aa6.75□□□□□ -1.33
GREB1-201ENST00000234142 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.73□□□□□ -1.33
GREB1-201ENST00000234142 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.71□□□□□ -1.33
GREB1-201ENST00000234142 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-201ENST00000234142 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GREB1-201ENST00000234142 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GREB1-201ENST00000234142 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GREB1-201ENST00000234142 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GREB1-201ENST00000234142 ITPR1Q14643 2758 aa6.56□□□□□ -1.36
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP10-8P60410 259 aa6.54□□□□□ -1.36
GREB1-201ENST00000234142 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.52□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 MGAQ8IWI9 3026 aa6.52□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 P0C880 135 aa6.48□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.48□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 FRYQ5TBA9 3013 aa6.48□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.47□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 TRANK1O15050 2925 aa6.47□□□□□ -1.37
GREB1-201ENST00000234142 REV3LO60673 3130 aa6.46□□□□□ -1.38
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.45□□□□□ -1.38
GREB1-201ENST00000234142 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GREB1-201ENST00000234142 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.35□□□□□ -1.39
GREB1-201ENST00000234142 TRIOO75962 3097 aa6.35□□□□□ -1.39
GREB1-201ENST00000234142 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GREB1-201ENST00000234142 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.34□□□□□ -1.39
GREB1-201ENST00000234142 LRBAP50851 2863 aa6.34□□□□□ -1.39
GREB1-201ENST00000234142 FRYLO94915 3013 aa6.33□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 TENM3Q9P273 2699 aa6.32□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.32□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 KALRNO60229 2985 aa6.32□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.32□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 H0YAA0 97 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-201ENST00000234142 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.7 ms