RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndufc2Q9CQ54 120 aa15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Akap9Q70FJ1 3797 aa15.59■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RbpjP31266 526 aa15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem160Q9D938 188 aa15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hspb8Q9JK92 196 aa15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhb2Q9QZC7 221 aa15.58■□□□□ 0.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trav9d-1A0A075B699 112 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700084M14RikB1AT01 78 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cited2O35740 269 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mamld1P0C6A2 803 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bsph2Q0Q236 131 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp1r3cQ7TMB3 317 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arl6ip6Q8BH07 226 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv14-3A0A075B5R9 117 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem141A2AJB2 108 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 H2al2bA9Z055 111 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sap30O88574 220 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ca2P00920 260 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sh2d6Q9D413 297 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tpsg1Q9QUL7 311 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcnx1Q9QYC1 2344 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp983E9PUT0 460 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ros1Q78DX7 2340 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AdipoqQ60994 247 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crip3Q6Q6R3 243 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca7Q91V24 2159 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Spta1P08032 2415 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv7-4A0A0A6YXL5 121 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem178aQ9CZ16 297 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm26920S4R2A5 56 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Srd5a2Q99N99 254 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BatfO35284 125 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ang4Q3TMQ6 144 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PirtQ8BFY0 135 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rln3Q8CHK2 141 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 UrahQ9CRB3 118 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erg28Q9ERY9 140 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cacna1aP97445 2368 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfhx3Q61329 3726 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trav16nA0A075B634 117 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tstd1E9PY03 133 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01896 185 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cd5P13379 494 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hrct1Q9D6B9 109 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trdv1A0A075B657 112 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm28778A0A087WSK7 233 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sub1P11031 127 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aqp6Q8C4A0 293 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca1P41233 2261 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P04944 107 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 GaptQ8CB93 157 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dkk2Q9QYZ8 259 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Npc2Q9Z0J0 149 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccl8Q9Z121 97 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca4O35600 2310 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc25a16Q8C0K5 332 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 QrfpQ8CE23 124 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr498Q8VEW2 330 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc25a39Q9D8K8 359 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trbv31A0A075B5J5 111 aa15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defa34D3Z0J0 93 aa15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fbxl15Q91W61 300 aa15.52■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rnf5O35445 180 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dlx6P70397 175 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Shisal2aA2A9G7 189 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17430F6RSK3 157 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bak1O08734 209 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myod1P10085 318 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fgf6P21658 208 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5150Q1AN92 299 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PdpnQ62011 172 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tln2Q71LX4 2375 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Odf3l1Q810P2 275 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q9D131 166 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Esp38A8R0X1 80 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5819E9PZ96 154 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5157A0A087WRH8 301 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem8bB1AWJ5 472 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q3UNZ8 350 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Muc15Q8C6Z1 331 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9958Q8C9U4 106 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.9 ms