Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
P04944 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P04944 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P04944 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P04944 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P04944 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P04944 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
P04944 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
P04944 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P04944 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04944 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
P04944 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04944 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P04944 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04944 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04944 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P04944 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04944 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04944 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04944 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
P04944 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04944 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04944 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04944 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04944 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
P04944 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P04944 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P04944 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P04944 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P04944 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04944 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04944 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P04944 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04944 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04944 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04944 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04944 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P04944 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04944 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04944 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P04944 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P04944 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P04944 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04944 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P04944 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04944 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P04944 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04944 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P04944 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04944 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04944 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P04944 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04944 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04944 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04944 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P04944 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04944 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04944 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04944 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P04944 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04944 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04944 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04944 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04944 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04944 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04944 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04944 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04944 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04944 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04944 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04944 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04944 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04944 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04944 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P04944 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04944 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04944 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04944 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04944 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04944 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04944 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04944 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P04944 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P04944 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04944 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04944 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04944 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P04944 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04944 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04944 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04944 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04944 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04944 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04944 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04944 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04944 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04944 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04944 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04944 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04944 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms