Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trdv1A0A075B657 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trdv1A0A075B657 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trdv1A0A075B657 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trdv1A0A075B657 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trdv1A0A075B657 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trdv1A0A075B657 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trdv1A0A075B657 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trdv1A0A075B657 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trdv1A0A075B657 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trdv1A0A075B657 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trdv1A0A075B657 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trdv1A0A075B657 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trdv1A0A075B657 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trdv1A0A075B657 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trdv1A0A075B657 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trdv1A0A075B657 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdv1A0A075B657 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trdv1A0A075B657 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trdv1A0A075B657 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trdv1A0A075B657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trdv1A0A075B657 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdv1A0A075B657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdv1A0A075B657 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdv1A0A075B657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdv1A0A075B657 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trdv1A0A075B657 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trdv1A0A075B657 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trdv1A0A075B657 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trdv1A0A075B657 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdv1A0A075B657 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trdv1A0A075B657 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdv1A0A075B657 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trdv1A0A075B657 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trdv1A0A075B657 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trdv1A0A075B657 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trdv1A0A075B657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trdv1A0A075B657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trdv1A0A075B657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdv1A0A075B657 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdv1A0A075B657 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trdv1A0A075B657 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trdv1A0A075B657 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trdv1A0A075B657 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trdv1A0A075B657 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdv1A0A075B657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trdv1A0A075B657 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trdv1A0A075B657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trdv1A0A075B657 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trdv1A0A075B657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trdv1A0A075B657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trdv1A0A075B657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trdv1A0A075B657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trdv1A0A075B657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trdv1A0A075B657 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trdv1A0A075B657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trdv1A0A075B657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trdv1A0A075B657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trdv1A0A075B657 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trdv1A0A075B657 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trdv1A0A075B657 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trdv1A0A075B657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trdv1A0A075B657 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trdv1A0A075B657 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trdv1A0A075B657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trdv1A0A075B657 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trdv1A0A075B657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trdv1A0A075B657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trdv1A0A075B657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trdv1A0A075B657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trdv1A0A075B657 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv1A0A075B657 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv1A0A075B657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv1A0A075B657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trdv1A0A075B657 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trdv1A0A075B657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trdv1A0A075B657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trdv1A0A075B657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trdv1A0A075B657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trdv1A0A075B657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trdv1A0A075B657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trdv1A0A075B657 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trdv1A0A075B657 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trdv1A0A075B657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trdv1A0A075B657 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trdv1A0A075B657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trdv1A0A075B657 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trdv1A0A075B657 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trdv1A0A075B657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trdv1A0A075B657 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trdv1A0A075B657 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trdv1A0A075B657 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trdv1A0A075B657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms