Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gm9958Q8C9U4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm9958Q8C9U4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm9958Q8C9U4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm9958Q8C9U4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm9958Q8C9U4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm9958Q8C9U4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm9958Q8C9U4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm9958Q8C9U4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm9958Q8C9U4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm9958Q8C9U4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm9958Q8C9U4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm9958Q8C9U4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm9958Q8C9U4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm9958Q8C9U4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm9958Q8C9U4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm9958Q8C9U4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm9958Q8C9U4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm9958Q8C9U4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm9958Q8C9U4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm9958Q8C9U4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm9958Q8C9U4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm9958Q8C9U4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm9958Q8C9U4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm9958Q8C9U4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm9958Q8C9U4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm9958Q8C9U4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm9958Q8C9U4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm9958Q8C9U4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm9958Q8C9U4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm9958Q8C9U4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm9958Q8C9U4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm9958Q8C9U4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm9958Q8C9U4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm9958Q8C9U4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm9958Q8C9U4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm9958Q8C9U4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm9958Q8C9U4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm9958Q8C9U4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm9958Q8C9U4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm9958Q8C9U4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm9958Q8C9U4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm9958Q8C9U4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm9958Q8C9U4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm9958Q8C9U4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm9958Q8C9U4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm9958Q8C9U4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm9958Q8C9U4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm9958Q8C9U4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm9958Q8C9U4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm9958Q8C9U4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm9958Q8C9U4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm9958Q8C9U4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm9958Q8C9U4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm9958Q8C9U4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm9958Q8C9U4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm9958Q8C9U4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm9958Q8C9U4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm9958Q8C9U4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm9958Q8C9U4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm9958Q8C9U4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm9958Q8C9U4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm9958Q8C9U4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm9958Q8C9U4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm9958Q8C9U4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm9958Q8C9U4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm9958Q8C9U4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm9958Q8C9U4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm9958Q8C9U4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm9958Q8C9U4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9958Q8C9U4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm9958Q8C9U4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm9958Q8C9U4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm9958Q8C9U4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9958Q8C9U4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm9958Q8C9U4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9958Q8C9U4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9958Q8C9U4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm9958Q8C9U4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9958Q8C9U4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9958Q8C9U4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9958Q8C9U4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm9958Q8C9U4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm9958Q8C9U4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9958Q8C9U4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm9958Q8C9U4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9958Q8C9U4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9958Q8C9U4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9958Q8C9U4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9958Q8C9U4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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