Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK92

Hspb8, Heat shock protein beta-8, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb8Q9JK92 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspb8Q9JK92 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hspb8Q9JK92 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspb8Q9JK92 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hspb8Q9JK92 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hspb8Q9JK92 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hspb8Q9JK92 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hspb8Q9JK92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hspb8Q9JK92 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hspb8Q9JK92 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hspb8Q9JK92 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hspb8Q9JK92 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hspb8Q9JK92 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hspb8Q9JK92 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hspb8Q9JK92 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb8Q9JK92 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb8Q9JK92 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb8Q9JK92 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb8Q9JK92 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb8Q9JK92 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hspb8Q9JK92 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hspb8Q9JK92 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hspb8Q9JK92 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hspb8Q9JK92 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hspb8Q9JK92 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hspb8Q9JK92 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hspb8Q9JK92 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hspb8Q9JK92 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspb8Q9JK92 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hspb8Q9JK92 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspb8Q9JK92 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspb8Q9JK92 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb8Q9JK92 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hspb8Q9JK92 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hspb8Q9JK92 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb8Q9JK92 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hspb8Q9JK92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb8Q9JK92 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hspb8Q9JK92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hspb8Q9JK92 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hspb8Q9JK92 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hspb8Q9JK92 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hspb8Q9JK92 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hspb8Q9JK92 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hspb8Q9JK92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hspb8Q9JK92 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hspb8Q9JK92 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hspb8Q9JK92 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hspb8Q9JK92 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hspb8Q9JK92 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hspb8Q9JK92 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hspb8Q9JK92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hspb8Q9JK92 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspb8Q9JK92 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hspb8Q9JK92 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hspb8Q9JK92 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspb8Q9JK92 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hspb8Q9JK92 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hspb8Q9JK92 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hspb8Q9JK92 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspb8Q9JK92 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspb8Q9JK92 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspb8Q9JK92 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspb8Q9JK92 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hspb8Q9JK92 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hspb8Q9JK92 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hspb8Q9JK92 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hspb8Q9JK92 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hspb8Q9JK92 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hspb8Q9JK92 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hspb8Q9JK92 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hspb8Q9JK92 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hspb8Q9JK92 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hspb8Q9JK92 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hspb8Q9JK92 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms