RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635849.1

ARID1B-210, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 5,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-210ENST00000635849 A0A1W2PNN7 141 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 KLK9Q2XQG4 91 aa6.94□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.94□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.94□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.93□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.92□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 UTRNP46939 3433 aa6.92□□□□□ -1.3
ARID1B-210ENST00000635849 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.92□□□□□ -1.3
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ARID1B-210ENST00000635849 Q8N377 158 aa6.91□□□□□ -1.3
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ARID1B-210ENST00000635849 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.89□□□□□ -1.31
ARID1B-210ENST00000635849 A0A0D9SG42 100 aa6.88□□□□□ -1.31
ARID1B-210ENST00000635849 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.88□□□□□ -1.31
ARID1B-210ENST00000635849 PCSK5Q92824 1860 aa6.87□□□□□ -1.31
ARID1B-210ENST00000635849 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ARID1B-210ENST00000635849 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.86□□□□□ -1.31
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ARID1B-210ENST00000635849 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.82□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.82□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 LUZP6Q538Z0 58 aa6.82□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 Q8N1X5 172 aa6.82□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 C15orf56Q8N910 161 aa6.82□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 A0A1W2PNM2 257 aa6.81□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.81□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.8□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.79□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 ZNF861PO60384 105 aa6.79□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.79□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.78□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 PRR34Q9NV39 138 aa6.78□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 Q1T7F1 81 aa6.78□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.78□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 WIPF1O43516 503 aa6.77□□□□□ -1.32
ARID1B-210ENST00000635849 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.77□□□□□ -1.33
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ARID1B-210ENST00000635849 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.76□□□□□ -1.33
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ARID1B-210ENST00000635849 OCR1Q9BZK8 76 aa6.74□□□□□ -1.33
ARID1B-210ENST00000635849 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.72□□□□□ -1.33
ARID1B-210ENST00000635849 ZNF575Q86XF7 245 aa6.72□□□□□ -1.33
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ARID1B-210ENST00000635849 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.71□□□□□ -1.33
ARID1B-210ENST00000635849 J3QL48 77 aa6.71□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.71□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 SPRR4Q96PI1 79 aa6.7□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.69□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 BPTFQ12830 3046 aa6.69□□□□□ -1.34
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ARID1B-210ENST00000635849 Q5XG85 94 aa6.68□□□□□ -1.34
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ARID1B-210ENST00000635849 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 CASC10Q5T4H9 136 aa6.68□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 IGLV7-43P04211 117 aa6.67□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 A0A1B0GU33 70 aa6.67□□□□□ -1.34
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ARID1B-210ENST00000635849 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 C5orf42Q9H799 3197 aa6.65□□□□□ -1.34
ARID1B-210ENST00000635849 KRTAP10-11P60412 298 aa6.65□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.64□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 CR1P17927 2039 aa6.63□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.63□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.63□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 HRES1P13985 223 aa6.63□□□□□ -1.35
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ARID1B-210ENST00000635849 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.63□□□□□ -1.35
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ARID1B-210ENST00000635849 K7EIL1 84 aa6.61□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.61□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 CSAG1Q6PB30 78 aa6.6□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.6□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ARID1B-210ENST00000635849 ATRQ13535 2644 aa6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 HTTP42858 3142 aa6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 A0A0C4DFX4 3053 aa6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 LINC00483Q53H64 154 aa6.58□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 A0A0A0MQY5 61 aa6.57□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 Q5VV11 94 aa6.57□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.57□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 MAST4O15021 2626 aa6.56□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 ITPR3Q14573 2671 aa6.56□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 SPINK7P58062 85 aa6.55□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 CFAP54Q96N23 3096 aa6.52□□□□□ -1.36
ARID1B-210ENST00000635849 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.52□□□□□ -1.37
ARID1B-210ENST00000635849 TRANK1O15050 2925 aa6.51□□□□□ -1.37
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