RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618698.4

CPEB1-217, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB1, Length 2,885 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-217ENST00000618698 NREPQ16612 68 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 Q6ZTC4 211 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 C6orf223Q8N319 242 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 NDUFC1O43677 76 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 CXCL6P80162 114 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 Q6ZQY7 126 aa6.41□□□□□ -1.38
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CPEB1-217ENST00000618698 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.39□□□□□ -1.39
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CPEB1-217ENST00000618698 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.37□□□□□ -1.39
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CPEB1-217ENST00000618698 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.36□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.36□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 HTN3P15516 51 aa6.36□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 NUPR2A6NF83 97 aa6.35□□□□□ -1.39
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CPEB1-217ENST00000618698 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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CPEB1-217ENST00000618698 COX17Q14061 63 aa6.34□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.34□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 C10orf25Q5T742 122 aa6.34□□□□□ -1.39
CPEB1-217ENST00000618698 IGKV4-1P06312 121 aa6.33□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 OCR1Q9BZK8 76 aa6.33□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 APLNQ9ULZ1 77 aa6.33□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 ERC2-IT1O76042 136 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 IGLV6-57P01721 117 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 C3orf84H3BNL1 204 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 A0A1B0GUV1 79 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 DIRC1Q969H9 104 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPEB1-217ENST00000618698 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB1-217ENST00000618698 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.29□□□□□ -1.4
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CPEB1-217ENST00000618698 REG3AQ06141 175 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.27□□□□□ -1.41
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CPEB1-217ENST00000618698 SMIM29Q86T20 159 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 PRR4Q16378 134 aa6.25□□□□□ -1.41
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CPEB1-217ENST00000618698 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.23□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 Q6ZRU5 148 aa6.23□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 Q1T7F1 81 aa6.23□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.23□□□□□ -1.41
CPEB1-217ENST00000618698 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.22□□□□□ -1.41
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CPEB1-217ENST00000618698 A8MU10 97 aa6.22□□□□□ -1.41
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CPEB1-217ENST00000618698 A8MUN3 132 aa6.19□□□□□ -1.42
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CPEB1-217ENST00000618698 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.17□□□□□ -1.42
CPEB1-217ENST00000618698 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CPEB1-217ENST00000618698 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CPEB1-217ENST00000618698 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.16□□□□□ -1.42
CPEB1-217ENST00000618698 LCE6AA0A183 80 aa6.16□□□□□ -1.42
CPEB1-217ENST00000618698 Q6ZR54 194 aa6.16□□□□□ -1.42
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