RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.12□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.12□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 SPANXCQ9NY87 97 aa12.12□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.11□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 S100A6P06703 90 aa12.1□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.1□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.1□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.09□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.09□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.09□□□□□ -0.47
ILF3-215ENST00000589485 HIST1H2BLQ99880 126 aa12.08□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 Q6ZRX8 168 aa12.07□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 SPANXDQ9BXN6 97 aa12.05□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 LPAP08519 4548 aa12.04□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.04□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 COPS9Q8WXC6 57 aa12.04□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 Q9BRP9 147 aa12.04□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 ERC2-IT1O76042 136 aa12.03□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 PCP2Q8IVA1 136 aa12.03□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 LINC00518Q8N0U6 118 aa12.03□□□□□ -0.48
ILF3-215ENST00000589485 HSBP1L1C9JCN9 74 aa12□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 LINC00483Q53H64 154 aa12□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 IFITM1P13164 125 aa11.99□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.99□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 Q6ZVH6 145 aa11.99□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.97□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.97□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 CTAG1AP78358 180 aa11.96□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 Q8NBF4 154 aa11.96□□□□□ -0.49
ILF3-215ENST00000589485 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.95□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.95□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 SCGB1D1O95968 90 aa11.93□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 MOBPQ13875 183 aa11.93□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 RNF213Q63HN8 5207 aa11.93□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 A6NDN8 102 aa11.92□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 COX7BP24311 80 aa11.92□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 C6orf99Q4VX62 202 aa11.92□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.92□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.91□□□□□ -0.5
ILF3-215ENST00000589485 C5orf52A6NGY3 159 aa11.89□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.88□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.88□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.86□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 SPINK1P00995 79 aa11.85□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.84□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.84□□□□□ -0.51
ILF3-215ENST00000589485 A0A1B0GWB2 263 aa11.83□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.83□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 SPRR1BP22528 89 aa11.8□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 TAL2Q16559 108 aa11.8□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.79□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.79□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 A4D1N5 150 aa11.78□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 COX8AP10176 69 aa11.78□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.78□□□□□ -0.52
ILF3-215ENST00000589485 TPRXLQ17RH7 258 aa11.77□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 HIST1H4GQ99525 98 aa11.77□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 CDIP1Q9H305 208 aa11.77□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.74□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 VAMP3Q15836 100 aa11.73□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 Q1RN00 199 aa11.73□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.73□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 DLEU1O43261 78 aa11.72□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 SPATA45Q537H7 98 aa11.72□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 SLC25A20O43772 301 aa11.71□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 Q8N377 158 aa11.71□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 C14orf144Q96I85 54 aa11.71□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 C12orf57Q99622 126 aa11.71□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 VAMP8Q9BV40 100 aa11.71□□□□□ -0.53
ILF3-215ENST00000589485 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.68□□□□□ -0.54
ILF3-215ENST00000589485 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.67□□□□□ -0.54
ILF3-215ENST00000589485 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ILF3-215ENST00000589485 PRO1933Q9H354 126 aa11.66□□□□□ -0.54
ILF3-215ENST00000589485 SMIM29Q86T20 159 aa11.64□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 LIMD2Q9BT23 127 aa11.64□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 LINC00575Q6W349 94 aa11.63□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 HIGD1BQ9P298 99 aa11.63□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.62□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 hADV29S1A0JD25 119 aa11.61□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 RAB37Q96AX2 223 aa11.61□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 H7C2G1 150 aa11.6□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 MUC17Q685J3 4493 aa11.6□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.59□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 MUC2Q02817 5179 aa11.58□□□□□ -0.55
ILF3-215ENST00000589485 CFC1BP0CG36 223 aa11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 CFC1P0CG37 223 aa11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 CD164Q04900 197 aa11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 Q6ZQY7 126 aa11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 F8WEM9 126 aa11.57□□□□□ -0.56
ILF3-215ENST00000589485 A0A0B4J2C4 111 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.1 ms