RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558827.1

SMAD3-208, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-208ENST00000558827 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 C5orf52A6NGY3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 Q8NBF4 154 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 Q9BRP9 147 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ZNF815PA8K554 130 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 NDUFC2O95298 119 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 IGLV6-57P01721 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ATOH7Q8N100 152 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 LITAFQ99732 161 aa7.18□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.17□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 MOBPQ13875 183 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 Q6ZRX8 168 aa7.16□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.15□□□□□ -1.26
SMAD3-208ENST00000558827 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 SCGB1D1O95968 90 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 LINC00483Q53H64 154 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 CDIP1Q9H305 208 aa7.14□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 TIMM17BO60830 172 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 SPANXCQ9NY87 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 MUC2Q02817 5179 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 PCP2Q8IVA1 136 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 MUC17Q685J3 4493 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-208ENST00000558827 C6orf99Q4VX62 202 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 SPINK1P00995 79 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 COX7BP24311 80 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 TPRXLQ17RH7 258 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 A6NDN8 102 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 CTAG1AP78358 180 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 VAMP8Q9BV40 100 aa7.04□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.04□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 TAL2Q16559 108 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 Q1RN00 199 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 Q8N377 158 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-208ENST00000558827 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 IFITM1P13164 125 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 FAT4Q6V0I7 4981 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 A0A0G2JQZ4 141 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 SLC25A20O43772 301 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 SPATA45Q537H7 98 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 PYY3Q5JQD4 70 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 COPS9Q8WXC6 57 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 SPRR1BP22528 89 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 COX8AP10176 69 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 A0A0U1RQV1 116 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 H7C2G1 150 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 Q6ZVH6 145 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD3-208ENST00000558827 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 C14orf144Q96I85 54 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 A0A1B0GWB2 263 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 DLEU1O43261 78 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 SMIM29Q86T20 159 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 C12orf57Q99622 126 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 A4D1N5 150 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 C9orf92A6NGG3 77 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 SMIM6P0DI80 62 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 HIST1H4GQ99525 98 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 PRO1933Q9H354 126 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 XP32Q5T750 250 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 LIMD2Q9BT23 127 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 HIGD1BQ9P298 99 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-208ENST00000558827 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-208ENST00000558827 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-208ENST00000558827 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-208ENST00000558827 VAMP3Q15836 100 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-208ENST00000558827 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms