RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 C15orf56Q8N910 161 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.3□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 F8WEM9 126 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 BPY2O14599 106 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR1AP35321 89 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 KLKP1Q107X0 134 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZRX8 168 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 NF1P21359 2839 aa3.29□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP10-11P60412 298 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 Q6ZRP5 223 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.28□□□□□ -1.88
AC024909.1-201ENST00000549278 H0Y9J4 135 aa3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 DPH3Q96FX2 82 aa3.27□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A087WVE0 104 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8NDZ9 215 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C7orf33Q8WU49 177 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR4Q96PI1 79 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.26□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 JMJD1CQ15652 2540 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 NOTCH2Q04721 2471 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C16orf90A8MZG2 172 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 NDUFB1O75438 58 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C5orf47Q569G3 176 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C1orf137Q5JT78 98 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 REG3GQ6UW15 175 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 C20orf197Q8N268 126 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8N377 158 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 MTORP42345 2549 aa3.25□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 ACANP16112 2415 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 ITPR2Q14571 2701 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 VPS13CQ709C8 3753 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 H3BPC8 53 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 PSCAO43653 123 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM236CP0DP71 79 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 Q8NBF4 154 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TENM4Q6N022 2769 aa3.24□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2BP63146 152 aa3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 H7BZZ5 65 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 SPRR1BP22528 89 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 RETNQ9HD89 108 aa3.22□□□□□ -1.89
AC024909.1-201ENST00000549278 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NUPR2A6NF83 97 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 EPM2AB3EWF7 344 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 IGKV4-1P06312 121 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 B9D2Q9BPU9 175 aa3.21□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 MP68P56378 58 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 Q9BRP9 147 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 OCR1Q9BZK8 76 aa3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFHX3Q15911 3703 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 LCE6AA0A183 80 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A1W2PNM2 257 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 K7EIL1 84 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.19□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 A0A0U1RQV1 116 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 hDV103S1A0JD37 113 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 HCG22E2RYF7 251 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 M0R2N4 97 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2AP49459 152 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 APLNQ9ULZ1 77 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 V9GYY9 64 aa3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 C3orf84H3BNL1 204 aa3.17□□□□□ -1.9
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms