RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBY1Q9Y3M2 126 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM74A7A6NL05 159 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS5O15539 181 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PFDN1O60925 122 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIX6O95475 246 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPBPP02775 128 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 C3orf79P0CE67 100 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS19P39019 145 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PMVKQ15126 192 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFTA2Q6UW10 78 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf62Q8N4C0 152 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMELXQ99217 191 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0J9YXY3 114 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0U1RRA0 63 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC160A6NGH7 325 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 COLCA2A8K830 154 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BRM9 83 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1EP04732 61 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPINK8P0C7L1 97 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM3P62310 102 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD39Q53RE8 183 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q5BKY6 102 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMN1Q8IY45 258 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1MQ8N339 61 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNFNQ9BYD5 112 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM3Q9BZL3 60 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 BIN3Q9NQY0 253 aa0.67□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf118A6NHY6 69 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMKR1H3BMG3 65 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNGT1P63211 74 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 COMMD7Q86VX2 200 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLEC2BQ92478 149 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM104AQ969W3 186 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf78Q9BR46 151 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIEN1Q9BRT3 115 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A14Q9HCY8 104 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYSLTR1Q9Y271 337 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 S4R3F8 94 aa0.66□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMSDA8MTL9 139 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFB6O95139 128 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB4AP20338 218 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CKS2P33552 79 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG4P50150 75 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERF2P84101 59 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPWQ5EE01 88 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6JHZ5 121 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf66Q6UXQ4 117 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFT2D1Q8WV19 159 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00862A6NCI5 91 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00587B1AMM8 73 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 PET100P0DJ07 73 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V0CP27449 155 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NMUP48645 174 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL23P62829 140 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEDD8Q15843 81 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM12Q96EX1 92 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPB11Q9Y547 144 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GUT8 65 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPXA8MT69 81 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EQZ3 153 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAGE4O60829 102 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV4-1P06312 121 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM13P0DJ93 91 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX7BP24311 80 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 G0S2P27469 103 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIGQ13278 110 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF726P1Q15940 193 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR13C6PQ8NH95 151 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANAPC16Q96DE5 110 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms