RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512701.6

TTC39B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39B, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TTC39B, Length 10,483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC39B-208	ENST00000512701	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701		Q8N377	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	CD164	Q04900	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	WIPF1	O43516	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701		H3BPC8	53 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	UQCR11	O14957	56 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC39B-208	ENST00000512701	PCNT	O95613	3336 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	LCA10	Q71F78	164 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A1W2PNM2	257 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	CRIPT	Q9P021	101 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701		H3BS24	57 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A1B0GVX0	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701		Q5XG85	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	BRCA2	P51587	3418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC39B-208	ENST00000512701	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A1B0GW54	56 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	CR1	P17927	2039 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	BPTF	Q12830	3046 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701		H3BNG1	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701	OXT	P01178	125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A096LNT2	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		Q8NDZ9	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	SPINK7	P58062	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		K7EIL1	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		Q1T7F1	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	ZNF861P	O60384	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	HRES1	P13985	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A087WTM6	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC39B-208	ENST00000512701		Q5VV11	94 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701		J3QL48	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701		Q75L30	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A1B0GU33	70 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TTC39B-208	ENST00000512701	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.78	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	ATR	Q13535	2644 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	TNP2	Q05952	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701		Q5W150	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TTC39B-208	ENST00000512701	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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