RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZVH6	145 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR4	Q96PI1	79 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV6-57	P01721	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246		B5MCH6	92 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	IFITM1	P13164	125 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZRX8	168 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	ATOH7	Q8N100	152 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf52	A6NGY3	159 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NDN8	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SCGB1D1	O95968	90 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	LITAF	Q99732	161 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	COX7B	P24311	80 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00483	Q53H64	154 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SPINK1	P00995	79 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8NBF4	154 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246		A4D1N5	150 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	MOBP	Q13875	183 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	VAMP3	Q15836	100 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf99	Q4VX62	202 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246		Q9BRP9	147 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GWB2	263 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A20	O43772	301 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TAL2	Q16559	108 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ERC2-IT1	O76042	136 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CDIP1	Q9H305	208 aa		6.57	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST1H4G	Q99525	98 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LRP2	P98164	4655 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0U1RQV1	116 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SNCG	O76070	127 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	LIMD2	Q9BT23	127 aa		6.53	□□□□□ -1.36
TTLL3-231	ENST00000496246	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		6.52	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	TPRXL	Q17RH7	258 aa		6.51	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246		F8WEM9	126 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR1B	P22528	89 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	VAMP8	Q9BV40	100 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	PRO1933	Q9H354	126 aa		6.5	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	COX8A	P10176	69 aa		6.49	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	DLEU1	O43261	78 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB37	Q96AX2	223 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246		Q1RN00	199 aa		6.47	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA45	Q537H7	98 aa		6.47	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.47	□□□□□ -1.37
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6.46	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NJY4	79 aa		6.46	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246		H7C2G1	150 aa		6.46	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	hADV29S1	A0JD25	119 aa		6.45	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	CD164	Q04900	197 aa		6.45	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		6.45	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	GHRH	P01286	108 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8N377	158 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	C14orf144	Q96I85	54 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	C12orf57	Q99622	126 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	HIGD1B	Q9P298	99 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LPA	P08519	4548 aa		6.44	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		6.43	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00575	Q6W349	94 aa		6.42	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	TCL1B	O95988	128 aa		6.41	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YGX0	51 aa		6.4	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.38

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