RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479490.1

SFT2D1-203, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SFT2D1, Length 2,061 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-203ENST00000479490 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.53□□□□□ -1.2
SFT2D1-203ENST00000479490 Q6ZRP5 223 aa7.53□□□□□ -1.2
SFT2D1-203ENST00000479490 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.53□□□□□ -1.2
SFT2D1-203ENST00000479490 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.53□□□□□ -1.2
SFT2D1-203ENST00000479490 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.53□□□□□ -1.2
SFT2D1-203ENST00000479490 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.52□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 KRTAP10-11P60412 298 aa7.52□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 SYCNQ0VAF6 134 aa7.52□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 SCXQ7RTU7 201 aa7.51□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.51□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.5□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 OXTP01178 125 aa7.5□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 FAM236CP0DP71 79 aa7.5□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 NOTCH1P46531 2555 aa7.49□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.49□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 KLKP1Q107X0 134 aa7.49□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.49□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 DNHD1Q96M86 4753 aa7.49□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.48□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 H7BZZ5 65 aa7.48□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.47□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.47□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 C7orf33Q8WU49 177 aa7.47□□□□□ -1.21
SFT2D1-203ENST00000479490 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.46□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.46□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 NREPQ16612 68 aa7.45□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.45□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.45□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.45□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 SNURFQ9Y675 71 aa7.45□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.44□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 C5orf47Q569G3 176 aa7.44□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 Q8N377 158 aa7.44□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 RMI2Q96E14 147 aa7.44□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.44□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 BPY2O14599 106 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 IGKV4-1P06312 121 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 C3orf84H3BNL1 204 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 PRYO14603 147 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 Q6ZRX8 168 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 MRAPQ8TCY5 172 aa7.43□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 F8WEM9 126 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 NDUFC1O43677 76 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 Q8N9L7 120 aa7.42□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.41□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 K7EIL1 84 aa7.41□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.4□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 Q5XG85 94 aa7.4□□□□□ -1.22
SFT2D1-203ENST00000479490 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.4□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A1B0GW54 56 aa7.4□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 ERC2-IT1O76042 136 aa7.4□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 EPM2AB3EWF7 344 aa7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 SPRR1AP35321 89 aa7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 Q9BRP9 147 aa7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 FAM168BA1KXE4 195 aa7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.39□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.38□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 C4orf26Q17RF5 130 aa7.37□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 TNP2Q05952 138 aa7.37□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 C1orf137Q5JT78 98 aa7.37□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 CASC10Q5T4H9 136 aa7.37□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A1W2PNM2 257 aa7.36□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 OCR1Q9BZK8 76 aa7.36□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.35□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 Q8NBF4 154 aa7.35□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.34□□□□□ -1.23
SFT2D1-203ENST00000479490 UBE2BP63146 152 aa7.33□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A0U1RQV1 116 aa7.32□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 SPRR4Q96PI1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.32□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 REG3GQ6UW15 175 aa7.31□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 SMIM29Q86T20 159 aa7.31□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.3□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 B9D2Q9BPU9 175 aa7.3□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.29□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.28□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.28□□□□□ -1.24
SFT2D1-203ENST00000479490 TENM3Q9P273 2699 aa7.27□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.27□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 DSCR10P59022 87 aa7.26□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 K7EQZ3 153 aa7.25□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 LCE6AA0A183 80 aa7.24□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A096LNI7 61 aa7.24□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 C16orf90A8MZG2 172 aa7.24□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 IGFL1Q6UW32 110 aa7.23□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 FBN3Q75N90 2809 aa7.23□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.22□□□□□ -1.25
SFT2D1-203ENST00000479490 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 230.4 ms