RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, human

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC6-208	ENST00000478914	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.01	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914		E9PLD3	99 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SPINK1	P00995	79 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	NPC2	P61916	151 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00483	Q53H64	154 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914		Q6ZRX8	168 aa		5	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914		A0A0J9YXY3	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	MOBP	Q13875	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	MUC2	Q02817	5179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914		Q9BRP9	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	XP32	Q5T750	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XRCC6-208	ENST00000478914	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	TIMM17B	O60830	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC25A20	O43772	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914		Q8N377	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	C20orf202	A1L168	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	KRTDAP	P60985	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	LITAF	Q99732	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	COX7B	P24311	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
XRCC6-208	ENST00000478914	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.9	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	SPRR1B	P22528	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	AKR1D1	P51857	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	TAL2	Q16559	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	IFITM1	P13164	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914		A6NDN8	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914		Q6ZVH6	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914		A0A1B0GWB2	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914		Q1RN00	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914		H7C2G1	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
XRCC6-208	ENST00000478914	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914		A4D1N5	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	CD164	Q04900	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	S100A2	P29034	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	VAMP3	Q15836	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
XRCC6-208	ENST00000478914		F8WEM9	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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