RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 TENM3Q9P273 2699 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 DSCR8Q96T75 97 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 PRYO14603 147 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 C7orf33Q8WU49 177 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 UBL5Q9BZL1 73 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR1AP35321 89 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC179H3BU77 68 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 ATOX1O00244 68 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 CASC10Q5T4H9 136 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRF-212ENST00000477970 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 TGP01266 2768 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 C3orf84H3BNL1 204 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 APLNQ9ULZ1 77 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 UQCRQO14949 82 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZRX8 168 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 CXCL6P80162 114 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 COX7CP15954 63 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 BCE1O60756 84 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZVQ6 151 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GW54 56 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 M0R2N4 97 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 C14orf177Q52M58 125 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 FAM168BA1KXE4 195 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 C16orf90A8MZG2 172 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N377 158 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 Q9BRP9 147 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 CRYGAP11844 174 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WVE0 104 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 SERP2Q8N6R1 65 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 TNP2Q05952 138 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 NUPR2A6NF83 97 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 REG3GQ6UW15 175 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 PSCAO43653 123 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 A0A096LNI7 61 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 HAMPP81172 84 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 LYSTQ99698 3801 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 H0Y9J4 135 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR4Q96PI1 79 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PNN7 141 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 ERC2-IT1O76042 136 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2BP63146 152 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 LCE6AA0A183 80 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 Q8NBF4 154 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 NREPQ16612 68 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf137Q5JT78 98 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM29Q86T20 159 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PNM2 257 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 EPM2AB3EWF7 344 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 SPRR1BP22528 89 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV4-1P06312 121 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM258P61165 79 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRF-212ENST00000477970 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 BPY2O14599 106 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRF-212ENST00000477970 F8WEM9 126 aa7.63□□□□□ -1.19
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