RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.39□□□□□ -2.63
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC7Q96NW7 1537 aa-1.4□□□□□ -2.63
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A1B0GUT8 65 aa-1.4□□□□□ -2.63
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PRPF40A-208ENST00000472760 ALKQ9UM73 1620 aa-1.41□□□□□ -2.64
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PRPF40A-208ENST00000472760 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.41□□□□□ -2.64
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PRPF40A-208ENST00000472760 RGPD5Q99666 1765 aa-1.46□□□□□ -2.64
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PRPF40A-208ENST00000472760 ATP7BP35670 1465 aa-1.46□□□□□ -2.64
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PRPF40A-208ENST00000472760 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.65□□□□□ -2.67
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PRPF40A-208ENST00000472760 PLXNC1O60486 1568 aa-1.67□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.67□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.67□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 NESP48681 1621 aa-1.68□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.68□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
PRPF40A-208ENST00000472760 LTN1O94822 1766 aa-1.68□□□□□ -2.68
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