RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 C3P01024 1663 aa0.93□□□□□ -2.26
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RABGGTB-205ENST00000462042 TJP1Q07157 1748 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CRIPTQ9P021 101 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CPS1P31327 1500 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 I3L2K1 104 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
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RABGGTB-205ENST00000462042 I3L3M4 83 aa0.9□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB123Q8N688 67 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FANCD2Q9BXW9 1451 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 F8P00451 2351 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY10Q96PN6 1610 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PRH1P02810 166 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB114Q30KQ6 69 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PRO0255Q9UI72 69 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 K7EQZ3 153 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FCER1GP30273 86 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SERF2P84101 59 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD6Q9H0Q3 95 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNQ1DNQ9H478 68 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ANK2Q01484 3957 aa0.88□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MROH2BQ7Z745 1585 aa0.87□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 Q8IZM0 81 aa0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NMES1Q9C002 83 aa0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.86□□□□□ -2.276e-10■■■■■ 59
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RABGGTB-205ENST00000462042 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.86□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 COX6B2Q6YFQ2 88 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 APCP25054 2843 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-205ENST00000462042 POLQO75417 2590 aa0.86□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa0.85□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 SMR3AQ99954 134 aa0.85□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 COX6B1P14854 86 aa0.84□□□□□ -2.27
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RABGGTB-205ENST00000462042 C4BP0C0L5 1744 aa0.84□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC8Q09428 1581 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R1W7 72 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 Q5VSD8 79 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 IQGAP2Q13576 1575 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTBN2O15020 2390 aa0.82□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 CMC2Q9NRP2 79 aa0.81□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 PRO3102Q9H379 93 aa0.8□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR1BP22528 89 aa0.78□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 APLNQ9ULZ1 77 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
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RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00158P58513 81 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PIEZO1Q92508 2521 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LYNX1G3V0Z9 82 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK4O60575 86 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF21BO75037 1637 aa0.75□□□□□ -2.29
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