RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8N377 158 aa14.7□□□□□ -0.06
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD164Q04900 197 aa14.32□□□□□ -0.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFITM1P13164 125 aa14.29□□□□□ -0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NDN8 102 aa14.28□□□□□ -0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.28□□□□□ -0.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZVH6 145 aa14.26□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKR1D1P51857 326 aa14.25□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCOTHQ58A44 107 aa14.25□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM29Q86T20 159 aa14.25□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.23□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.23□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATOH7Q8N100 152 aa14.23□□□□□ -0.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q5XG85 94 aa14.21□□□□□ -0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A4D1N5 150 aa14.2□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCP2Q8IVA1 136 aa14.2□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.17□□□□□ -0.14
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JQZ4 141 aa14.16□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf195Q5TG92 126 aa14.16□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.15□□□□□ -0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa14.14□□□□□ -0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT1HP80294 61 aa14.06□□□□□ -0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAMP3Q15836 100 aa14.06□□□□□ -0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCL1BO95988 128 aa14.05□□□□□ -0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8WEM9 126 aa14.04□□□□□ -0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL37P61927 97 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00575Q6W349 94 aa14.01□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFC1BP0CG36 223 aa13.99□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZQY7 126 aa13.97□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 hADV29S1A0JD25 119 aa13.96□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.96□□□□□ -0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.95□□□□□ -0.18
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