RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TCL1BO95988 128 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 PSMB2P49721 201 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 Q9HAA7 133 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 USP17L23D6RBM5 183 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 PANO1I0J062 215 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00694P0DN24 101 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM101Q96IK0 257 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 PRAC1Q96KF2 57 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 CARD19Q96LW7 228 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 PRR34Q9NV39 138 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A20O43772 301 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LST1O00453 97 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LECT2O14960 151 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 ACYP1P07311 99 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 Q6Q795 121 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZUT4 128 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM243Q9BU79 118 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRACP01848 142 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 Q9UF83 564 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WZ39 114 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 COX7A2LO14548 114 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 SPINK8P0C7L1 97 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 COX6A2Q02221 97 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 REG3GQ6UW15 175 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZTI0 123 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 DPH3Q96FX2 82 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GV72 72 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 C9JAW5 83 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 H0YGX0 51 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2L6O14933 153 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 IMUPQ9GZP8 106 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TNXBP22105 4242 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GX51 115 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 COX17Q14061 63 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 PRO0255Q9UI72 69 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 PRR4Q16378 134 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 Q1RN00 199 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf82Q6UX34 121 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 COX7B2Q8TF08 81 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 A8MU10 97 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFC2O95298 119 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 CXCL5P42830 114 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 Q8IZM0 81 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 DAND5Q8N907 189 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2WQ96B02 151 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 H3BQ85 93 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 SS18Q15532 418 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 CKS1BP61024 79 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 GAGE2BQ13066 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 GAGE2EQ4V326 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf33Q8WU49 177 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 RMI2Q96E14 147 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 H7C2G1 150 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRK-211ENST00000429595 SNCGO76070 127 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms