RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410554.1

RNU6-77P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-77P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-77P-201ENST00000410554 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 ACANP16112 2415 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 COL6A3P12111 3177 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 GNG2P59768 71 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 SMARCA2P51531 1590 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 ACYP1P07311 99 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-77P-201ENST00000410554 NDUFA3O95167 84 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 TDRG1Q3Y452 100 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 NESP48681 1621 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 NWD1Q149M9 1564 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 NDUFB1O75438 58 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 REV3LO60673 3130 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 NCOA2Q15596 1464 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-77P-201ENST00000410554 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 H0YGG7 62 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 MED14O60244 1454 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPRR2AP35326 72 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 ST20Q9HBF5 79 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 NBASA2RRP1 2371 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 TRANK1O15050 2925 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-77P-201ENST00000410554 ADIRFQ15847 76 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 PRO3102Q9H379 93 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 IFI6P09912 130 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 S100A13Q99584 98 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 MUC2Q02817 5179 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 C3orf79P0CE67 100 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 PDZD2O15018 2839 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 LINC00158P58513 81 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 PLXNC1O60486 1568 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 PKHD1P08F94 4074 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 WIZO95785 1651 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 AKAP13Q12802 2813 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-77P-201ENST00000410554 RICTORQ6R327 1708 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 LYSTQ99698 3801 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 A0A087WXM4 84 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 H3BUT2 72 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 NREPQ16612 68 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 ERVK-7P63135 1459 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 DEPDC5O75140 1603 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 LCE6AA0A183 80 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 NDUFA4O00483 81 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPRR2EP22531 72 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-77P-201ENST00000410554 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms