RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.35□□□□□ -0.43
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SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP1-201ENST00000357436 Q9BRP9 147 aa12.04□□□□□ -0.48
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SH3BP1-201ENST00000357436 BPY2O14599 106 aa12□□□□□ -0.49
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SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf84H3BNL1 204 aa11.97□□□□□ -0.49
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SH3BP1-201ENST00000357436 C4orf26Q17RF5 130 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 OCR1Q9BZK8 76 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf137Q5JT78 98 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 REG3GQ6UW15 175 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2BP63146 152 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8NBF4 154 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRR4Q96PI1 79 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CHTF8P0CG12 524 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM29Q86T20 159 aa11.85□□□□□ -0.51
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