RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.72□□□□□ -1.17
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CDCA8-201ENST00000327331 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.71□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.71□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.7□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 CASC10Q5T4H9 136 aa7.7□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.7□□□□□ -1.18
CDCA8-201ENST00000327331 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.7□□□□□ -1.18
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CDCA8-201ENST00000327331 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.68□□□□□ -1.18
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CDCA8-201ENST00000327331 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.61□□□□□ -1.19
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CDCA8-201ENST00000327331 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.61□□□□□ -1.19
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CDCA8-201ENST00000327331 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.6□□□□□ -1.19
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CDCA8-201ENST00000327331 CXCL6P80162 114 aa7.59□□□□□ -1.19
CDCA8-201ENST00000327331 V9GYY9 64 aa7.59□□□□□ -1.19
CDCA8-201ENST00000327331 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.58□□□□□ -1.2
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CDCA8-201ENST00000327331 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.58□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 C6orf99Q4VX62 202 aa7.58□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 SEC61GP60059 68 aa7.57□□□□□ -1.2
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CDCA8-201ENST00000327331 LINC00575Q6W349 94 aa7.57□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.56□□□□□ -1.2
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CDCA8-201ENST00000327331 NREPQ16612 68 aa7.55□□□□□ -1.2
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CDCA8-201ENST00000327331 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.55□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 SYCNQ0VAF6 134 aa7.54□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 SCXQ7RTU7 201 aa7.54□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.54□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 PDE6GP18545 87 aa7.53□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 DNAH2Q9P225 4427 aa7.53□□□□□ -1.2
CDCA8-201ENST00000327331 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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CDCA8-201ENST00000327331 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.51□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 BPY2O14599 106 aa7.51□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 Q6ZRP5 223 aa7.51□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 Q6ZQY7 126 aa7.5□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 PRYO14603 147 aa7.49□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 Q6ZR54 194 aa7.49□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.48□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 C3orf84H3BNL1 204 aa7.48□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.48□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 H3BQ85 93 aa7.47□□□□□ -1.21
CDCA8-201ENST00000327331 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.46□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 FAM168BA1KXE4 195 aa7.45□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.44□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.44□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 OCR1Q9BZK8 76 aa7.44□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 IGLV6-57P01721 117 aa7.43□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.43□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 Q8N9L7 120 aa7.43□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 A0A087WTM6 91 aa7.43□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 IGKV4-1P06312 121 aa7.43□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 CHTF8P0CG12 524 aa7.42□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 A0A096LNI7 61 aa7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 VPREB1P12018 145 aa7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 PRR15Q8IV56 129 aa7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CDCA8-201ENST00000327331 C14orf177Q52M58 125 aa7.41□□□□□ -1.22
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