RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf212bD3Z423 297 aa16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbx1P62878 108 aa16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr127Q8VF25 323 aa16.44■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28778A0A087WSK7 233 aa16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01736 120 aa16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbp4Q00724 201 aa16.43■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SstP60041 116 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shisal1Q0VBP7 198 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr411Q7TRW8 315 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9130230L23RikQ8CC80 163 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhb2Q9QZC7 221 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PspnO70300 156 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P04944 107 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1434Q7TQR9 312 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm12689Q8BQU9 117 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10190Q8BSD7 107 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tomm40Q9QYA2 361 aa16.42■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp114B2RRA8 586 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm765B2RVL9 189 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 eef1akmt3D3YWP0 232 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mc5rP41149 325 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spsb3Q571F5 354 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1454Q8VFW2 307 aa16.41■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm2174F6ZVF2 133 aa16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TbpP29037 316 aa16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr958Q8VEY3 312 aa16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plrg1Q922V4 513 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NpyP57774 97 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znrd1Q791N7 123 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9945Q8BNZ3 91 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stxbp6Q8R3T5 210 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1199Q8VF94 310 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EsdQ9R0P3 282 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r61W4VSP5 300 aa16.39■□□□□ 0.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map1aQ9QYR6 2776 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MgpP19788 104 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KncnQ307W7 124 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr16Q62007 309 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1272Q8VGN8 308 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxl15Q91W61 300 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3512L7N206 146 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb1bp1O35671 200 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 F2rl1P55086 399 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q24JP4 165 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox7a2lQ61387 111 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chchd5Q9CQP3 110 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stpg1Q9D2F5 341 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hcfc2Q9D968 241 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cml3Q9JIY8 226 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ros1Q78DX7 2340 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav6d-7A0A075B6B0 112 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdkn1aP39689 159 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fabp6P51162 128 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp5iQ06185 71 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scgb2b24Q7M747 112 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubtd1Q91WB7 227 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15056F6ZR08 88 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sub1P11031 127 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igll1P20764 209 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9130213A22RikQ3V3T2 120 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr149Q60888 311 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr823Q7TRH2 315 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem89Q9DA04 169 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dolpp1Q9JMF7 238 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ovol1Q9WTJ2 267 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4791J3QQ14 102 aa16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Saa4P31532 130 aa16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CampP51437 172 aa16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hnrnpa3Q8BG05 379 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm17660B9UIU9 90 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 YrdcQ3U5F4 280 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CtrlQ9ER05 264 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm16442D3YZG3 307 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tstd1E9PY03 133 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam208bQ5DTT3 2382 aa16.35■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cspg4Q8VHY0 2327 aa16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-16A0A075B5U1 98 aa16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptrh2Q8R2Y8 181 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1242Q8VGM6 306 aa16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspo2Q9CRZ8 162 aa16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Onecut1O08755 465 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gfra1P97785 468 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10188Q3V432 135 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gng7Q61016 68 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr211Q8VGH2 309 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znhit3Q9CQK1 151 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtoglF7A4A7 2325 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C2cd3Q52KB6 2323 aa16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms