Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Gfra1P97785 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gfra1P97785 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gfra1P97785 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gfra1P97785 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gfra1P97785 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gfra1P97785 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gfra1P97785 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfra1P97785 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gfra1P97785 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gfra1P97785 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gfra1P97785 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gfra1P97785 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gfra1P97785 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gfra1P97785 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gfra1P97785 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gfra1P97785 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gfra1P97785 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gfra1P97785 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfra1P97785 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gfra1P97785 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfra1P97785 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gfra1P97785 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gfra1P97785 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra1P97785 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gfra1P97785 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gfra1P97785 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gfra1P97785 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra1P97785 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfra1P97785 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gfra1P97785 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gfra1P97785 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gfra1P97785 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gfra1P97785 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfra1P97785 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gfra1P97785 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gfra1P97785 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gfra1P97785 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra1P97785 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra1P97785 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gfra1P97785 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gfra1P97785 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gfra1P97785 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra1P97785 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra1P97785 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra1P97785 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra1P97785 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gfra1P97785 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra1P97785 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra1P97785 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra1P97785 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra1P97785 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra1P97785 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra1P97785 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra1P97785 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra1P97785 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra1P97785 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra1P97785 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gfra1P97785 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra1P97785 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra1P97785 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra1P97785 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra1P97785 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfra1P97785 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfra1P97785 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra1P97785 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra1P97785 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra1P97785 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra1P97785 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra1P97785 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra1P97785 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra1P97785 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra1P97785 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra1P97785 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra1P97785 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra1P97785 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra1P97785 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra1P97785 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gfra1P97785 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra1P97785 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfra1P97785 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfra1P97785 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfra1P97785 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra1P97785 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfra1P97785 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfra1P97785 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfra1P97785 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfra1P97785 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfra1P97785 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra1P97785 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfra1P97785 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfra1P97785 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfra1P97785 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfra1P97785 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra1P97785 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfra1P97785 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra1P97785 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra1P97785 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra1P97785 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra1P97785 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms