RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 PET117Q6UWS5 81 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 C22orf24Q9Y442 160 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 A0A0U1RRA0 63 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 C20orf202A1L168 122 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 J3QQQ9 107 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 OXTP01178 125 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LINC01545Q5VT33 79 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 GAGE10A6NGK3 116 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LINC00587B1AMM8 73 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 C3orf79P0CE67 100 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 NMUP48645 174 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 MYCBP2O75592 4640 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 E9PLD3 99 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 IGLV7-43P04211 117 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 SMIM13P0DJ93 91 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 VPREB1P12018 145 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 S100A6P06703 90 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 S100A2P29034 98 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 REG3GQ6UW15 175 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LINC00167Q96N53 147 aa5.65□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 DIRC1Q969H9 104 aa5.64□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 IGKV2D-28P01615 120 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 Q8NDZ9 215 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 H0Y9J4 135 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 BCE1O60756 84 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 AKR1D1P51857 326 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 DAND5Q8N907 189 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.62□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 A0A0J9YXY3 114 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 ZNF815PA8K554 130 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 NCR3O14931 201 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 LCE2CQ5TA81 110 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 ATOH7Q8N100 152 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 M0R378 163 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 ZNF861PO60384 105 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 GHRHP01286 108 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 MT1HL1P0DM35 61 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 UBE2AP49459 152 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 LINC01600Q96MT4 127 aa5.6□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 TMEM238C9JI98 176 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.59□□□□□ -1.51
NELFE-214ENST00000625905 TIMM17BO60830 172 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 NPC2P61916 151 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 TMEM126AQ9H061 195 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 PRYO14603 147 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 S100A12P80511 92 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 PRLHP81277 87 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 C5orf52A6NGY3 159 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 LITAFQ99732 161 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.55□□□□□ -1.52
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NELFE-214ENST00000625905 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.55□□□□□ -1.52
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NELFE-214ENST00000625905 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.55□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SCGB1D1O95968 90 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 PCP2Q8IVA1 136 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SPANXCQ9NY87 97 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 HERC1Q15751 4861 aa5.54□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-214ENST00000625905 SPRR1AP35321 89 aa5.52□□□□□ -1.53
NELFE-214ENST00000625905 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
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