RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	GAGE10	A6NGK3	116 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC01600	Q96MT4	127 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	SMIM13	P0DJ93	91 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	DIRC1	Q969H9	104 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	MT1HL1	P0DM35	61 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968		J3QQQ9	107 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	VPREB1	P12018	145 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	PET117	Q6UWS5	81 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968		H0Y9J4	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF861P	O60384	105 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	BCE1	O60756	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	IGKV2D-28	P01615	120 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	NMU	P48645	174 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTDAP	P60985	99 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968		Q8NDZ9	215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TIMM44-208	ENST00000598968		E9PLD3	99 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP10-8	P60410	259 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	UBE2A	P49459	152 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	DAND5	Q8N907	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	C20orf202	A1L168	122 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968		M0R378	163 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM238	C9JI98	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	NCR3	O14931	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A0J9YXY3	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM126A	Q9H061	195 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	HERC1	Q15751	4861 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	S100A2	P29034	98 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM44-208	ENST00000598968	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	S100A6	P06703	90 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	PRLH	P81277	87 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF815P	A8K554	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ATOH7	Q8N100	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	NPC2	P61916	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	AKR1D1	P51857	326 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TIMM44-208	ENST00000598968	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	PRY	O14603	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	S100A12	P80511	92 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	TIMM17B	O60830	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	NDUFC2	O95298	119 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	DDT	P30046	118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	LITAF	Q99732	161 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TIMM44-208	ENST00000598968	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	CRYGA	P11844	174 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	SPRR1A	P35321	89 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A087X002	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	PCP2	Q8IVA1	136 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV6-57	P01721	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TIMM44-208	ENST00000598968	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TIMM44-208	ENST00000598968	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TIMM44-208	ENST00000598968	TNXB	P22105	4242 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TIMM44-208	ENST00000598968	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		13.37	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms