RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 HIST1H4GQ99525 98 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 K7EP34 96 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 DAND5Q8N907 189 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 RAB37Q96AX2 223 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 NDUFA1O15239 70 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 OXTP01178 125 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 VPS25Q9BRG1 176 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1W2PPM0 123 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 FABP2P12104 132 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 NPC2P61916 151 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 FXYD2P54710 66 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 KIAA0087Q14695 138 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 TAL2Q16559 108 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 LITAFQ99732 161 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 PRSS2P07478 247 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 CEND1Q8N111 149 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 PFN2P35080 140 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C10orf25Q5T742 122 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 Q8IZM0 81 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 K7ERJ3 54 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 CKS1BP61024 79 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SPAG11BQ08648 103 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 C15orf56Q8N910 161 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 APOMO95445 188 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM238C9JI98 176 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00158P58513 81 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 HERV-K104P63124 156 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 A4D1N5 150 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 RMI2Q96E14 147 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 ERG28Q9UKR5 140 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 TIMM17BO60830 172 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 MT1HL1P0DM35 61 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SPANXCQ9NY87 97 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 TNXBP22105 4242 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 USP17L23D6RBM5 183 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 CFC1BP0CG36 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 CFC1P0CG37 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 SLPIP03973 132 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 F8W1H4 67 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZRU5 148 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 LRP2P98164 4655 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1B0GWB2 263 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 CXCL5P42830 114 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 J3QR89 54 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 SFTA2Q6UW10 78 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 H7C2G1 150 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 PANO1I0J062 215 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 IFITM1P13164 125 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 SYCNQ0VAF6 134 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 C14orf177Q52M58 125 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 C2orf48Q96LS8 159 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 H3BMG7 143 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 COX17Q14061 63 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 Q8NDZ9 215 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 GAGE2EQ4V326 116 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 IGKV2D-28P01615 120 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZRP5 223 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF213Q63HN8 5207 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 TSPAN13O95857 204 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.07□□□□□ -1.28
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