RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 AMELXQ99217 191 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGIPA6NJ69 53 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFA4O00483 81 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV2-11P01706 119 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 A6NED7 52 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK2AP2O75956 126 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 REG3GQ6UW15 175 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N814 137 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 VWFP04275 2813 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0J9YWU9 116 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB135Q30KP9 77 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 SPINK9Q5DT21 86 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV2-14P01704 120 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV2-23P01705 113 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-23P01764 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 LIMD2Q9BT23 127 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 P0C879 139 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 SOCS3O14543 225 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 NREPQ16612 68 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR15LQ9BU68 103 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 MUC4Q99102 2169 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 GAS8-AS1O95177 125 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 S4R3C0 116 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 Q86TA4 180 aa3.09□□□□□ -1.91
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0J9YX75 114 aa3.09□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.09□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.09□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 PROP1O75360 226 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB131AP59861 70 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 UBL5Q9BZL1 73 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 CASC2Q6XLA1 102 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 TNCP24821 2201 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0J9YXY3 114 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 CTSGP08311 255 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 LITAFQ99732 161 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 TENM3Q9P273 2699 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 CRPP02741 224 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 ROMO1P60602 79 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 PRCDQ00LT1 54 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N3U1 123 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 NCR3O14931 201 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 HTN3P15516 51 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 MIAQ16674 131 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 KLK9Q2XQG4 91 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087X002 238 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 BPY2O14599 106 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 CRIP1P50238 77 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL18P55774 89 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms