RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC5O15440 1437 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCAPERQ9BY12 1400 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OOSP1A8MZH6 123 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM262E9PQX1 116 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0Y9P7 68 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPKBP1O60336 1514 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.11□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP290O15078 2479 aa-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.12□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf77A4D0Y5 90 aa-1.13□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.13□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.13□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYSTQ99698 3801 aa-1.13□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.13□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHLPP1O60346 1717 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WVE0 104 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFC1O43677 76 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.14□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KALRNO60229 2985 aa-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNAPC5O75971 98 aa-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMCHL1Q16048 86 aa-1.15□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.16□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD5Q9P267 1494 aa-1.16□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMG4Q5JS54 123 aa-1.16□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOP2BQ02880 1626 aa-1.16□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.17□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-1.17□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC2Q92887 1545 aa-1.17□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN7AQ01118 1682 aa-1.17□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.17□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 K7EP13 123 aa-1.18□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPC2O95563 127 aa-1.18□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFA5Q01523 94 aa-1.18□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP5Q13017 1502 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG4P50150 75 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGN3Q15651 99 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCORQ6W2J9 1755 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYOM2P54296 1465 aa-1.19□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H7BZZ5 65 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 K7EP34 96 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UQCRHP07919 91 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP3R1P63098 170 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A12P80511 92 aa-1.2□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM218A2RU14 115 aa-1.21□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFA2O43678 99 aa-1.21□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-1.21□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.21□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-1.22□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.22□□□□□ -2.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.22□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KNDC1Q76NI1 1749 aa-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOCADQ5VW36 1801 aa-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSD52Q0P140 79 aa-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RELNP78509 3460 aa-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUX1P39880 1505 aa-1.24□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.24□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.24□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD5Q99666 1765 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGN1P05114 100 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LELP1Q5T871 98 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.25□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUL7Q14999 1698 aa-1.26□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms