RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ERG28Q9UKR5 140 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.1□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 A8MUN3 132 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BMG7 143 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKCP01834 107 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 TCRAP04437 139 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM236CP0DP71 79 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 PYYP10082 97 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 WFDC2Q14508 124 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 ETDBQ3ZM63 59 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 Q86TA4 180 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 PRELID3AQ96N28 172 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 OTORQ9NRC9 128 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 DPM2O94777 84 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NCR2O95944 276 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 EVI2AP22794 236 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-DMBP28068 263 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 FXYD2P54710 66 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 GNG5P63218 68 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PLGLAQ15195 96 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 RRN3P1Q2M238 152 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 C12orf74Q32Q52 190 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 DAND5Q8N907 189 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 R4GN34 69 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GU33 70 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 D6R8Y8 96 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 G3V318 75 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 LY6LH3BQJ8 138 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 RBP4P02753 201 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PLNP26678 52 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 CKS2P33552 79 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZUT4 128 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TRGV9Q99603 122 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 A8MWV9 139 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 K7ERJ3 54 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SNCGO76070 127 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 FCER1GP30273 86 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 AMTNQ6UX39 209 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PATE2Q6UY27 113 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TEN1Q86WV5 123 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PRO0461Q9UI25 63 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01546A6NGU7 62 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-ATP8P03928 68 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6Q795 121 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 C20orf78Q9BR46 151 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087WX48 190 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFC2O95298 119 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 NPYP01303 97 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 IFITM1P13164 125 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 PDE6HQ13956 83 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 Q8N6K4 173 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 Q8N8P6 123 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM126AQ9H061 195 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADBP1-201ENST00000478954 SPANXCQ9NY87 97 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms