RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM236CP0DP71 79 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 PDE6GP18545 87 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 NDUFC1O43677 76 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 Q6ZTI0 123 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 Q8IZM0 81 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 XCL1P47992 114 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 TENM3Q9P273 2699 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-201ENST00000402521 H7BZZ5 65 aa6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 CXCL6P80162 114 aa6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C4orf26Q17RF5 130 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C16orf74Q96GX8 76 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 PRO0628Q9UI54 55 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 PAX4O43316 350 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 DEFB130BP0DP73 79 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 DEFB130AP0DP74 79 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C6orf223Q8N319 242 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A1B0GUV1 79 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 Q6ZQT0 140 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 ERC2-IT1O76042 136 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 DNHD1Q96M86 4753 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 DEFB135Q30KP9 77 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 PFN2P35080 140 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 ENHOQ6UWT2 76 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A096LPF7 62 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00575Q6W349 94 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C20orf197Q8N268 126 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 SLPIP03973 132 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 KRTAP10-11P60412 298 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-201ENST00000402521 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 RETNQ9HD89 108 aa6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA0087Q14695 138 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 Q6ZVQ6 151 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 HTN3P15516 51 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 IGLV6-57P01721 117 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 X6R8D5 127 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 CELA1Q9UNI1 258 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 C6orf99Q4VX62 202 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-201ENST00000402521 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A0J9YWU9 116 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 TENM2Q9NT68 2774 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 COL7A1Q02388 2944 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 F8WEM9 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 Q8N3U1 123 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A1B0GW54 56 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 F8WDY8 70 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 MIFP14174 115 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 LYSTQ99698 3801 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 GYPEP15421 78 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 RMI2Q96E14 147 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 NREPQ16612 68 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 COX7BP24311 80 aa6.21□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 HAMPP81172 84 aa6.21□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.21□□□□□ -1.41
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A0U1RQV1 116 aa6.21□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 Q8NDZ9 215 aa6.21□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 PRO0255Q9UI72 69 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 LCE6AA0A183 80 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-201ENST00000402521 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms