RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.17□□□□□ -0.3
SPNS1-201ENST00000311008 Q8NDZ9 215 aa13.17□□□□□ -0.3
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SPNS1-201ENST00000311008 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
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SPNS1-201ENST00000311008 C15orf56Q8N910 161 aa13.01□□□□□ -0.33
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SPNS1-201ENST00000311008 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZQY7 126 aa12.97□□□□□ -0.33
SPNS1-201ENST00000311008 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.97□□□□□ -0.33
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SPNS1-201ENST00000311008 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.83□□□□□ -0.36
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SPNS1-201ENST00000311008 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.81□□□□□ -0.36
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.81□□□□□ -0.36
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZVQ6 151 aa12.78□□□□□ -0.36
SPNS1-201ENST00000311008 UPK3BQ9BT76 320 aa12.78□□□□□ -0.36
SPNS1-201ENST00000311008 M0R2N4 97 aa12.77□□□□□ -0.37
SPNS1-201ENST00000311008 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.76□□□□□ -0.37
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
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SPNS1-201ENST00000311008 C7orf33Q8WU49 177 aa12.75□□□□□ -0.37
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