RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB130BP0DP73 79 aa11.35□□□□□ -0.59
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB130AP0DP74 79 aa11.35□□□□□ -0.59
AFG3L2-201ENST00000269143 IL17DQ8TAD2 202 aa11.35□□□□□ -0.59
AFG3L2-201ENST00000269143 Q8NDZ9 215 aa11.35□□□□□ -0.59
AFG3L2-201ENST00000269143 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.34□□□□□ -0.59
AFG3L2-201ENST00000269143 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.33□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.32□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 LINC00575Q6W349 94 aa11.32□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 Q6ZQY7 126 aa11.32□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 ESM1Q9NQ30 184 aa11.32□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 VWFP04275 2813 aa11.32□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 MIFP14174 115 aa11.31□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.31□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 Q8N9L7 120 aa11.31□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.3□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 Q6YL49 198 aa11.3□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 CR1P17927 2039 aa11.3□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 Q8IZM0 81 aa11.29□□□□□ -0.6
AFG3L2-201ENST00000269143 DAD1P61803 113 aa11.27□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 NREPQ16612 68 aa11.27□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 C1orf195Q5TG92 126 aa11.27□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.27□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.26□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.26□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.26□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.25□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 C6orf223Q8N319 242 aa11.25□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB4AO15263 64 aa11.25□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 BPY2O14599 106 aa11.24□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 BCE1O60756 84 aa11.24□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 MUC7Q8TAX7 377 aa11.24□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 CCL24O00175 119 aa11.24□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 GYPEP15421 78 aa11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 CXCL6P80162 114 aa11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 C16orf74Q96GX8 76 aa11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.23□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 DSCR9P59020 149 aa11.22□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 V9GYY9 64 aa11.22□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 ATRQ13535 2644 aa11.22□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 NDUFC1O43677 76 aa11.22□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 F8WDY8 70 aa11.21□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 FSHBP01225 129 aa11.21□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
AFG3L2-201ENST00000269143 KIAA0087Q14695 138 aa11.21□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 C10orf25Q5T742 122 aa11.21□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.2□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 LINC01006Q8NI28 216 aa11.2□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 SEC61GP60059 68 aa11.19□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 F8P00451 2351 aa11.18□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.17□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 PDZD2O15018 2839 aa11.17□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.16□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 COX17Q14061 63 aa11.16□□□□□ -0.62
AFG3L2-201ENST00000269143 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.629e-8■□□□□ 9.4
AFG3L2-201ENST00000269143 PRYO14603 147 aa11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 HTN3P15516 51 aa11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 PDE6GP18545 87 aa11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.14□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.13□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 HIVEP1P15822 2718 aa11.13□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 ESRGQ1W209 222 aa11.13□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 C3orf84H3BNL1 204 aa11.12□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 CELA1Q9UNI1 258 aa11.12□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 REG3AQ06141 175 aa11.11□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 A0A1B0GUV1 79 aa11.11□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 DIRC1Q969H9 104 aa11.11□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.11□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 SPAG11BQ08648 103 aa11.11□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.1□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 IGLV6-57P01721 117 aa11.1□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.09□□□□□ -0.63
AFG3L2-201ENST00000269143 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.08□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.08□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.08□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 IGKV4-1P06312 121 aa11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 KLK12Q9UKR0 248 aa11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 COX7BP24311 80 aa11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 Q6ZTC4 211 aa11.07□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.06□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 OCR1Q9BZK8 76 aa11.06□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PRR4Q16378 134 aa11.04□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PSPHP1O15172 72 aa11.03□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.03□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.03□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 PRO0255Q9UI72 69 aa11.02□□□□□ -0.64
AFG3L2-201ENST00000269143 ERC2-IT1O76042 136 aa11.01□□□□□ -0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 SMIM29Q86T20 159 aa11.01□□□□□ -0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 BAHCC1Q9P281 2608 aa11□□□□□ -0.65
AFG3L2-201ENST00000269143 DEFB135Q30KP9 77 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms