RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 LINC01549A6NIU2 74 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 IFITM1P13164 125 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 REG3AQ06141 175 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 GAGE2BQ13066 116 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 WFDC2Q14508 124 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 GAGE2EQ4V326 116 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 Q9HAA7 133 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 A0A087WTM6 91 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 M0QXV9 152 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 PSCAO43653 123 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 SNCGO76070 127 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 ETDBQ3ZM63 59 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 MT-ATP8P03928 68 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GX51 115 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 J3KT08 172 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 XGP55808 180 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 PRO0461Q9UI25 63 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 TOMM6Q96B49 74 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 TEN1Q86WV5 123 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 CEND1Q8N111 149 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 FAM104AQ969W3 186 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 TIMM17AQ99595 171 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GGA3-209ENST00000580646 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 IGIPA6NJ69 53 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 F8WDY8 70 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 SS18Q15532 418 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 C14orf177Q52M58 125 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 Q8N1X5 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 TMEM141Q96I45 108 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 Q8N814 137 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 HBDP02042 147 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 KRTAP10-1P60331 282 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 AMELXQ99217 191 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 A0A096LNJ9 63 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 CCDC179H3BU77 68 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 NMUP48645 174 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 BAALCQ8WXS3 180 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 USP17L23D6RBM5 183 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 FXYD2P54710 66 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 MYCBP2O75592 4640 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 XCL1P47992 114 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 UBE2D1P51668 147 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 ATP5LO75964 103 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 PMVKQ15126 192 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 EPM2AB3EWF7 344 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 COX7A2LO14548 114 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 LECT2O14960 151 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 PRSS1P07477 247 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-209ENST00000580646 C15orf56Q8N910 161 aa6.45□□□□□ -1.38
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