RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 SSSCA1O60232 199 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 NBEAP1P0C6P0 100 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 B2MP61769 119 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSLPQ969D9 159 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRIPTQ9P021 101 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 BPTFQ12830 3046 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 PHLPP1O60346 1717 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 J3QR89 54 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGLC1P0CG04 106 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBE2D3P61077 147 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBE2D2P62837 147 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 LCN9Q8WX39 176 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-448P-201ENST00000517052 K7ERU9 68 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 NEFHP12036 1026 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 S100A5P33763 92 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 I3L3M4 83 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 M0R2Z0 102 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 BTG2P78543 158 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 MT1HP80294 61 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 DEFA5Q01523 94 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 LELP1Q5T871 98 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 DPH3Q96FX2 82 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRO1933Q9H354 126 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CFTRP13569 1480 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CKS1BP61024 79 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 SEC11AP67812 179 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADGRL2O95490 1459 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 C4AP0C0L4 1744 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 C4BP0C0L5 1744 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 COPZ1P61923 177 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMCO1Q147U7 214 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TOP2BQ02880 1626 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GU69 56 aa-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms