RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM13P0DJ93 91 aa3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 PTTG1IPP53801 180 aa3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 MIAQ16674 131 aa3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SFTA2Q6UW10 78 aa3.25□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 APOMO95445 188 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2V1Q13404 147 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 C6orf223Q8N319 242 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 COX7B2Q8TF08 81 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 KLK12Q9UKR0 248 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 H3BNG1 76 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 TNP2Q05952 138 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA25Q9BR10 227 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 C10orf25Q5T742 122 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.24□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 K7EP34 96 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 CASC10Q5T4H9 136 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 MTURNQ8N3F0 131 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 VAMP3Q15836 100 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 TIMM17BO60830 172 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2D-28P01615 120 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM238C9JI98 176 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 PRO0461Q9UI25 63 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SS18Q15532 418 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 C15orf56Q8N910 161 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0B4J2C4 111 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 H3BMG7 143 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 H7C2G1 150 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TCL1BO95988 128 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PRSS2P07478 247 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 Q8IZM0 81 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2WQ96B02 151 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 B9D2Q9BPU9 175 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIAP1O43715 76 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PFN2P35080 140 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CCL18P55774 89 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE10A6NGK3 116 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 COX7A2LO14548 114 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 ERG28Q9UKR5 140 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SLPIP03973 132 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 APLNQ9ULZ1 77 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 FABP2P12104 132 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 HERV-K104P63124 156 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 WFDC2Q14508 124 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TGP01266 2768 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 IFITM1P13164 125 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SPAG11BQ08648 103 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CLEC2BQ92478 149 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PKD1P98161 4303 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 PSMB2P49721 201 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00158P58513 81 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 Q9HAA7 133 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.18□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 MALP21145 153 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZRU5 148 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 C22orf24Q9Y442 160 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 UPK3BQ9BT76 320 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CRPP02741 224 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms